問題タブ [r-caret]

R のキャレット パッケージを使用してブースト回帰ツリーとランダム フォレスト モデルを実行してきましたが、組み込みの相互検証ルーチンを使用して一連の新しいケースの予測間隔を生成したいと考えています。

trainControl 関数を使用すると、n フォールドごとにホールドアウト予測を保存できますが、組み込み関数を使用して各フォールドで未知のケースも予測できるかどうか、または別の関数を使用する必要があるかどうか疑問に思っています。モデルを n 回構築するためのループ。

どんなアドバイスも大歓迎です

R では、切片のないモデルを次のように指定します。

ただし、同じモデルをキャレットで適合させると、結果のモデルには切片が含まれます。

caret::trainインターセプト項を除外するにはどうすればよいですか?

キャレット パッケージの関数を使用して、rfeロジスティック回帰モデルの機能選択を行っています。Rsquaredsizesを使用して最適なモデルを選択するために、5、10、15、20、および 25 を調べています (私の従属変数は 0,1 です)。rfe最終的に選択されたモデルを超えて、関数によって生成された他のモデルにアクセスする方法はありますか?

カレットで2つのランダムフォレストを実行する場合、ランダムシードを設定するとまったく同じ結果が得られます。

ただし、モデリングを高速化するために並列バックエンドを登録すると、モデルを実行するたびに異なる結果が得られます。

この問題を解決する方法はありますか？1つの提案は、doRNGパッケージを使用することでしたがtrain、現在サポートされていないネストされたループを使用します。

doSNOW更新：この問題はとを使用して解決できると思いましclusterSetupRNGたが、そこに到達することはできませんでした。

foreachの何が特別で、クラスターで開始したシードを使用しないのはなぜですか？オブジェクトaとbは同一なので、なぜそうではないmodel1のmodel2ですか？

私の質問は 、Caret パッケージを使用する場合のカテゴリ データ (R 用語の要因) に関するthis oneに関連しています。リンクされた投稿から、「数式インターフェイス」を使用すると、一部の機能が要因となり、トレーニングが正常に機能することがわかりました。preProcess()私の質問は、関数を使用してデータをスケーリングするにはどうすればよいですか? 因子としていくつかの列を含むデータ フレームで実行しようとすると、次のエラー メッセージが表示されます。

ここでいくつかのサンプルコードを参照してください:

ありがとうございました。

bayesglmロジスティック回帰の問題に使用しています。これは、150行と2000変数のデータセットです。私は変数選択を行おうとしていますが、通常はで調べglmnetますcaret::rfe。ただし、のメソッドはありませんbayesglm。

とにかく手動でメソッドを定義する方法はありrfeますか？

ライブラリのrfe機能について質問があります。caretcaret-homepageリンクでは、次の RFE アルゴリズムが提供 されています。

この例では、rfe関数を 3 分割交差検証で使用し、train関数を線形 SVM と 5 分割交差検証で使用しています。

• 上記のアルゴリズムから、このアルゴリズムは 2 つのネストされた交差検証で機能すると仮定しました。
  1. rfeデータ（150サンプル）を3つのフォールドに分割します
  2. このtrain関数は、トレーニング セット (100 サンプル) で実行され、モデル パラメーターを調整するための 5 分割交差検証が行われ、その後の RFE が使用されます。

私を混乱させるのは、rfe関数の結果を見ると、次のことです。

このことから、5 倍の cv からのトレーニング セットのサイズは、サイズが 80 であると予想される場合、120 サンプルであることがわかります。

したがって、誰かがrfeとtrainがどのように連携するかを明確にできれば幸いです。

乾杯

カレットを使用する場合、トレーニング後にモデルを保存し、後で（別のセッションなどで）予測のためにモデルをロードするにはどうすればよいですか？

パッケージcaretを使用して、さまざまなトレーニングモデルの予測の統計を取得しようとしています。以下は私の必要性を説明する例です：

pred4つのモデルのX_kandY_から予測の統​​計（ROCなど）を取得するにはどうすればよいですか？

caretユーザー定義のパフォーマンスメトリックを使用して、いくつかのネストされた相互検証プロセスにRのパッケージを使用しようとしています。私はさまざまな問題を抱えていたので、すぐに使用できる問題がないかどうかを確認するために引き返しましたが、問題が発生したcaretようです。

私が以下を実行した場合：

エラー（または同様の）が発生します：

{：タスク1のエラーが失敗しました-「引数は行数が異なることを意味します：619、381」

警告付き：

しかし、gbmルーチンだけを実行すると、すべてが正常に終了します。