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大学の研究室に参加したばかりで、自分が書いた C++ コードをコンパイルして実行するためのクラスターへのアクセス権が与えられました。SSH を使用してアクセスし、Linux ターミナルのようにクラスターを使用します。

コードの実行中に比較的長い時間待たなければならないことがよくあります。クラスターをより効率的に使用する方法があるかどうかを把握しようとしています。たとえば、クラスターにはさまざまな CPU/ノードがあり、そのうちのいくつかはより多く使用され、他のものはあまり使用されていません。特定の CPU にアクセスするにはどうすればよいですか? さまざまなノードに関する情報を提供する「Ganglia」概要ページにアクセスできます。

また、別の SSH ウィンドウで 2 つのプロセスを実行すると、別のプロセッサまたはノードが自動的に使用されますか、それとも手動で指定する必要がありますか。

これらの問題に役立つドキュメントが見つからなかったので、少し助けていただければ幸いです。

ありがとう

スレーブノードでインタラクティブにRの実行を開始する方法はありますか？

qloginを使用してサーバーにログインすることはできますが、これでは、ヘッドノードで実行されるemacs+essを起動できません。

ありがとう！

@newuserの要求に従って、PATH変数の次の部分が見つかりました。これらは、ヘッドノードにある場合にのみ検出されますが、スレーブノードにある場合はパスから削除されます。

/ opt / eclipse：/ opt / maven / bin：/ opt / dell / srvadmin / bin

仕事で、Matlab分散コンピューティングサーバーR2011aをRocksCentOSクラスターにインストールしようとしています。指示に従って、ISOをマウントし、。/ install＆を実行します。インストーラーはスプラッシュ画面を表示しますが、クラッシュして以下のエラーメッセージを出力します。

致命的なエラーがJavaランタイム環境によって検出されました。

SIGSEGV（0xb）at pc = 0x0000003d39471c7c、pid = 29673、tid = 1105340736

JREバージョン：6.0_17-b04 Java VM：Java HotSpot（TM）64ビットサーバーVM（14.3-b01混合モードlinux-amd64）問題のあるフレーム：C [libc.so.6 + 0x71c7c]

バグレポートを送信する場合は、http： //java.sun.com/webapps/bugreport/crash.jspにアクセスしてください。

上司と私はhttp://greg.porter.name/wiki/HowTo:MatlabOnRocksで、まったく同じ問題を抱えているが、それを修正する方法を理解していない人による記事を見つけました。他の誰かがこの問題に遭遇しましたか？誰かが修正を見つけた場合、私はあなたがこの問題を修正するためにどのような手順を踏んだかを知ることに非常に興味があります。

Rocksフロントエンドをインストールした後、次のコマンドを使用してフロントエンドに新しいノードを追加してみました

この問題を解決するにはどうすればよいですか？

PS：サーバーは他の誰かによってインストールされたので、おそらく彼は必要なすべてのコンポーネントをインストールしなかったと思います。

私の rpm の 1 つは、手動で行うと適切に yum インストールできますが、何らかの理由で、その特定のパッケージを含む新しいディストリビューションを作成した後にノードを再起動すると、インストール プロセスが中断されます。

extend-compute などのインストール後のセクションで「yum install package.rpm」を実行するだけで問題を回避できるかどうか疑問に思っています。

または、パッケージが最初にインストールを中断する理由について誰かが私にヒントを与えることができれば、それは同様に役に立ちますか?

ありがとう。

突然ラボのクラスターの管理者になり、道に迷ってしまいました。Linux サーバーの管理経験はありますが、クラスターの管理経験はありません。クラスターはかなり違うようです。

クラスターは CentOS と ROCKS を実行していると考えました。どの SGE がクラスターで使用されているかどうかはわかりません。

クラスターの構成方法と管理方法の概要またはドキュメントを教えてください。私はグーグルで調べましたが、クラスターを構築する方法はたくさんあるようで、どこから始めればよいかわかりません。

MS VC++ プログラムをロック クラスターで実行するように移植しようとしています。私は Linux があまり得意ではありませんが、学ぶことに熱心であり、Linux を移植することは私にとって不可能な作業ではないと思います。ただし、クラスター ノードを利用する方法がわかりません。コード実行はフロントエンドサーバーでのみ実行されるように見えるためです（明らかに）。

MPI について少し読んだことがありますが、MPI を使用してノード間で通信する必要があるようです。プログラムは現在、すべてのワーカー スレッドを同期するメイン スレッドを持つように作成されています。メインスレッドは、シミュレーションを操作したり、その状態を照会したりするためのコマンドも受け取ります。シミュレーションが適切にセットアップされていれば、実行中のスレッド間の通信を大幅に最小限に抑えることができます。理解できないのは、計算ノードでプロセスを開始する方法と、ノードでの障害を処理する方法です。また、プログラムをクラスターで実行するように移植するときに、他にも考慮すべきことがあるでしょうか?

次のスクリプトを使用して、ノードでプロセスを開始しています。メインノードから:

問題は、compute-2-10 に接続すると、実行中のジョブが表示されないことです。問題は、bash が終了を待たないため、プロセスを完了できないことだと思います。これは正しいですか、それとも何か他のことをする必要がありますか?

Rocks クラスターを使用するのは初めてです。実行中rocks-develにパッケージが削除されました

インストールしようとするrocks-devel-env-6.0-1.x86_64.rpmと、エラーが発生します

エラー: 失敗した依存関係:

/opt/rocks/bin/python は rocks-devel-env-6.0-1.x86_64 で必要です

これをどのように解決すればよいですか？