問題タブ [roxygen2]

最小限のケースを示すために、次のパッケージがあるとします。

私がroxygenize（RStudioで、「Build & Reload」の前に）。私は得る：

何がうまくいかないのですか？このエラーを解決するにはどうすればよいですか?

私のセットアップ：

• Roxygen2 3.1.0
  • roxygen を使用して生成します (RStudio で):
    • Rd ファイル
    • 照合フィールド
    • 名前空間ファイル
  • 実行時に自動的に roxygenising (RStudio で):
    • R CMD チェック
    • ソースおよびバイナリ パッケージのビルド
    • ビルド＆リロード
• R: 3.0.2 (フリスビーセーリング)
• IDE: RStudio 0.98.490
• OS: Windows 8.1

バイオコンダクタパッケージ「メチルイルミ」で利用可能なサードパーティ機能を利用したRパッケージを開発しています

最初の R パッケージのコードでは、methylumi を .xml でインポートしlibrary(methylumi)ます。

開発中 (私は roxygen2 と devtools を使用)、すべて正常に動作します。ただし、パッケージをインストールして関数を実行すると、エラーが発生します: could not find function "methylumIDAT".

もちろん、パッケージを手動でインポートすればすべてが解決しますがmethylumi、自分のパッケージをロードするたびに利用できるようにするにはどうすればよいですか?

したがって、関数の roxygen2 コメント内でパッケージのビネットの 1 つを参照したいのですが、その方法を理解するのに苦労しています。

より一般的には、内部のドキュメントをどのように参照します/inst/docか? /inst/doc/mypdf.pdfたとえば、 の roxygen2 コメント内を参照したいと思いますmyFunc。それはどのように見えるでしょうか？それは可能ですか？

myPackageと呼ばれるパッケージから1つの関数を使用したいas.data.frame.mywhateverS3class

パッケージ NAMESPACE を見ると、次のS3method(as.data.frame, mywhateverS3class) ようになります。この関数を別のパッケージ内で使用したいと考えています。私が通常行うことは、これroxygen2を @import myPackage として指定して、これimport(myPackage)が他のパッケージ内で生成されるようにすることです。それはうまくいきます。

ただし、この場合、パッケージ全体ではなく、S3 メソッドのみをインポートしたいと考えています。を指定するimportFrom(myPackage, as.data.frame)と、またはimportFrom(myPackage, as.data.frame.mywhateverS3class)as.data.frame がエクスポートされずmyPackage、入力時に as.data.frame.mywhateverS3class が非表示になるため、これは失敗しますmethods(as.data.frame)

このためにパッケージ全体の NAMESPACE を本当にインポートする必要がありますか? http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-exts.htmlを見ていますが、名前空間全体をインポートせずにインポートを S3 メソッドだけに制限する方法が見つからないようです。これを行う方法はありますか？

importFrom使用中に呼び出しをフォーマットする方法は何roxygen2ですか?

私は2つのアプローチを見ることができます：

また

明らかに、基本関数をパッケージにインポートしませんが、これはデモ用です。

パッケージをビルドすると、このエラーが発生します。このエラーを回避するための手順を教えてください。

ビルドを押したときのエラーは次のとおりです。

という名前のパッケージを作成し、その中にtestという名前の関数を持ってladいます。ビルドして で確認するとcran=TRUE、次のエラーが表示されます。何がうまくいかないのですか？

私のパッケージpower.RのRフォルダーにある関数内のコードは次のとおりです。test

チェックする前にこれまでに実行したコマンドは次のとおりです。

[Build & Reload] をクリックしても問題は発生せず、次のように表示されます。