問題タブ [simpleitk]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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python - itk::NeighborhoodIterator python ラッピング

ITK python ラッパー (simpleITK ではなく ITK) を使用して、μCT 出力の自動処理のプロトタイプを作成しています。3D オブジェクトの厚さマップを計算する必要がありますが、この機能はそのままでは ITK に存在しません。パイプラインは単純です。

  • オブジェクトを二値化する
  • 距離変換を計算する
  • 中心軸を距離マップ local-max として抽出します

私の問題は、itk::RegionalMaximaImageFilterが期待どおりに動作しないことです (ブランチが保持されません)。そこで、3x3x3 のスライディング カーネルを使用して、中央のピクセルがその近傍まで離れているかどうかをチェックするカスタム関数を書きたいと思いました。

私の考えは、最適化されたitk::RegionalMaximaImageFilterイテレータを利用することです (こちらを参照)。ただし、これが C++ で完全に機能する場合でも、Python で回避策を見つけることができません (c コードを cython でラップする必要があります)。

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python - Ubuntu for Python に SimpleElastix をインストールする際の問題

Python2または3のUbuntuコンピューターに、作業できる方にSimpleElastix/SimpleITKをインストールしようとしています。pip install を使用しても、さまざまなメソッドがインポートされないため機能しません (たとえば、「GetDefaultParameterMethod」が存在しません)。彼らの Web サイト ( https://simpleelastix.readthedocs.io/GettingStarted.html#compiling-on-linux ) の指示に従ってみましたが、プロセス全体でエラーは発生しませんが、まだインポートできません。Python3 の場合、典型的な「No module」エラーがポップアップしますが、Python2 の場合は次のようになります。

どんな助けでも大歓迎です:)

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user-interface - GUI モジュールが見つかりません

次のコードを実行しようとしています。

Spider 3.2.6 で実行すると、次のようになります: ModuleNotFoundError: No module named 'gui'

どんな助けでも大歓迎です。

コード ソース: http://insightsoftwareconsortium.github.io/SimpleITK-Notebooks/Python_html/30_Segmentation_Region_Growing.html