問題タブ [singularity-container]

Docker コンテナー内で特異点を実行しようとしています。ただし、「squashfs」機能を.simg特異点画像で機能させる方法を理解または理解できないようです。

このコマンドが次のことを示しているいくつかのディスカッション スレッドを見てきました。

cat /proc/filesystems|grep squashfs

を返す必要squashfsがありますが、docker コンテナー内で実行すると、単に空白行が表示されます。「squashfs のインストール」ガイドを見てみましたが、それらはすべてカーネルのパッチ適用とアップグレードを伴うようで、これは私の理解が少し足りません。

具体的には、.simg で発生しているエラーは次のとおりです。

singularity exec myimage.simg

また、「マウント」を使用して .simg をマウントしようとしましたが、次のようになります。

mount -o loop,offset=31 myimage.simg /mnt

mount: /mnt: unknown filesystem type 'squashfs'.

明らかな何かが欠けているように感じます。Docker化されたものにsquashfsを追加するにはどうすればよいですか?

目的は、Feynhiggs / Higgsbounds/HiggsSignal / 2HDMC / SusHi が一緒に平和に動作する特異点コンテナーを作成することです。これらは強力な組み合わせですが、設定が面倒です。私の結果を再現する方法として、このコンテナーを提供できるようにしたいと考えています。

これを行うには、いくつかのハックが必要です。たとえば、2HDMC は主に Higgsbounds バージョン 5 を必要としますが、HiggsBounds バージョン 4 のレガシー関数も 1 つ使用するため、HiggsBounds 5 をコンパイルする前にレガシー関数を HiggsBounds 5 のソースに挿入します。私が必要とすることをする唯一のプログラム。これはほんの一例です。ほとんどすべてのパッケージは、一緒に使用することを意図していますが、連携するにはソースを変更する必要があります。

原則として、これらすべての変更を特異点レシピにsed代入として書き込むことができますが、おそらく完全に読み取り不能なレシピ ファイルが作成されます。別の方法として、変更が必要なすべてのファイルの zip を作成し、それらをレシピに置き換えることもできます. それはまた、変更がどこにあるかをレシピから明らかにするでしょう.

特異点でコンパイルする前にソースをハッキングするための標準的な方法はありますか?