問題タブ [vignette]
For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.
r - R: 線形混合効果ライブラリ (lme4) の「ビネットのインストールに失敗しました」
私は R についてほとんど知識がなく、現在、事前に作成された R スクリプトを実行しようとしています。
私の重要な問題は、ライブラリの 1 つ (lme4 - 線形混合効果ライブラリ) がインストールされていないように見えることです。
スクリプトは次の依存関係で始まります -
出力は次のようになり、最後にエラーが発生します。
関連するものmatch.argと、それ以外のオプションを設定している可能性のある場所を調べてみまし"verbatim", "tex", "hide"たが、運がありませんでした。
エラーの原因は何ですか?
ありがとう！
r - Rビネットで.rdaオブジェクトが認識されない
R パッケージを作成していて、data フォルダー内に graph.rda ファイルがあります。
.rmd ビネット ファイルの RStudio で、次のデータを読み取りました。
しかし、.rmd ビネット ファイルを "Knit HTML" すると、上記の 2 行で次のようなエラーが表示されます。
私は解決策を調査しようとしましたが、いくつかの提案 (library(knitr) の追加など) を試しましたが、役に立ちませんでした。
どんなアドバイスでも大歓迎です！
r - ar パッケージ ビネットを作成しようとしています
DESeq2 ( http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/DESeq2/inst/doc/DESeq2.pdf ) で見たのと同様の r パッケージ ビネットを作成しようとしています。目次と、それと残りのビネットの間のリンク、ページ数などが気に入っています。きれいでプロフェッショナルに見えます。
私は KnitrBootstrap ( https://github.com/jimhester/knitrBootstrap ) と buildVignettes (リンクを投稿できません - 1 つの質問で 3 番目 - ここで Stackoverflow の新しいメンバーとして - 申し訳ありません!) について少し見ましたが、私はしません '彼らが私が探しているものだとは思いません。
自分のパッケージ用に簡単に調整できる DESeq2 ビネットのサンプル形式を見つけることは可能ですか? どんなアドバイスでも大歓迎です！
html - R devtools: ビネットの html と pdf の両方を作成する
パッケージの 1 つについて、ビネット形式でチュートリアルを作成しました。
正常に動作しますが、ビネットの html バージョンしか作成しません。ビネットの HTML バージョンと PDF バージョンの両方を作成する方法はありますか?
.Rmd ファイルの出力フィールドに rmarkdown::pdf を追加しようとしましたが、うまくいきませんでした。
linux - ssh を介した R ビネットの閲覧 (またはダウンロード)
仕事用のコンピューター (Linux Mint OS) に ssh 経由で接続しています。パッケージを使用しようとしていますが、ドキュメントを読む必要があります。ドキュメントは、browseVignettes("package_name") から入手できます。ただし、sshで接続しているため、pdfファイルが開きません。PDF をローカル マシンにダウンロードしたり、ssh 経由で読んだりするにはどうすればよいですか? パッケージ名はCODEXです。
編集：私はMac OSを使用しています
r - パッケージ vignette の R コードは、セキュリティ上の理由から CRAN で実行できません。そのようなビネットを管理する方法は？
R パッケージは、プライベートな user_name とパスワードを使用して商用データベースと通信し、接続を確立します。package_vignette.Rmd ファイルには、コードのチャンクがあります。
私には実際の user_name と password を CRAN に提供する権利がないため、パッケージに本物の「connection.config」ファイルを提供することはできません。したがって、もちろん、このコード フラグメントは CRAN チェック中にエラーを引き起こします。
CRANチェックを回避する2つの方法を知っています：
ニットオプションを使用してください:
eval = FALSE.R.rspパッケージの助けを借りて静的ビネットを作成します。
最初の方法は、たくさんのチャンクがあり、ビネットを頻繁に書き直したり再構築したりするため、時間がかかりすぎます。私には 2 番目の方法が適しています。しかし、そのようなビネットをサポートするためのより良いパターンがあるのではないでしょうか? たとえば、パッケージのテストでは、testthat::skip_on_cran()CRAN チェックを回避するために使用します。