4

パッケージのインストールで繰り返し発生する問題があり、多くの場合、次のようになります。

> install.packages("Biobase")
Installing package(s) into ‘/usr/local/lib/R/site-library’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning in install.packages("Biobase") :
  'lib = "/usr/local/lib/R/site-library"' is not writable
Would you like to create a personal library
~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15
to install packages into?  (y/n) y
--- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
Loading Tcl/Tk interface ... done
Warning message:
package ‘Biobase’ is not available (for R version 2.15.0)

私のSys.info()は次のとおりです。

> Sys.info()
                                     sysname 
                                     "Linux" 
                                     release 
                          "2.6.32-40-server" 
                                     version 
"#87-Ubuntu SMP Tue Mar 6 02:10:02 UTC 2012" 
                                    nodename 
                                    "******" 
                                     machine 
                                    "x86_64" 
                                       login 
                                        "**" 
                                        user 
                                        "**" 
                              effective_user 
                                        "**"

エラーはpackage ‘Biobase’ is not available (for R version 2.15.0)、個人用ライブラリにインストールする必要があるためですか (明らかに、私が作業しているサーバーでは、通常のライブラリは書き込み可能ではありません)。パッケージをインストールしようとするたびに、同じ「2.15 では利用できません」というエラーが表示されるようです。

4

2 に答える 2

4

このBiobaseパッケージは、CRANではなくBioconductorで入手できます。これはあなたがそれをインストールする方法です：

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("Biobase")

詳細については、 Bioconductorを参照してください。

于 2012-04-24T16:00:10.233 に答える