bioinformatics - 爆風与えられたGINCBIヌクレオチドデータベース

Question

私は、GI番号によって一意に識別されるいくつかのシーケンスを含むローカルデータベース駆動型のWebサイトを持っています。GIを直接与えられた「NCBIブラストサイト」にリンクすることは可能ですか？たとえば、GI903049のシーケンスには次のリンクがあります。

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/903049

このブラストページにリンクしています：

http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&QUERY=U22848.1&DATABASE=nr&MEGABLAST=on&BLAST_PROGRAMS=megaBlast&LINK_LOC=nuccore&PAGE_TYPE=BlastSearch

NCBIに行かなくても、このサイトに直接リンクしたいと思います。ありがとう。

Answer 1

ncbi efetch を使用して、すべての GIS をダウンロードできます。

http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=nuccore&id=903049&rettype=fasta&retmode=text

ローカル バージョンの blast を実行します: http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=Download

Biostar に質問することもできます: http://www.biostars.org/show/questions/