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すでにBioPerlストアオブジェクト(BIO:DB:SeqFeature:Store)を使用してGFF3 DBを作成しました。Blastxの結果からGFF3ファイルを自分で作成し、属性として一連の独自のタグを作成しました。次に、BioPerlが作成したデータベースからこの値を取得します。

どうすればいいですか?

助けてください!大いに感謝する。

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パッケージにこれを行うための関数が存在することがわかりましたBIO::SeqFeature::Generic。最も便利なのはget_tag_values、入力で指定された特定のタグを持つ属性に含まれる各値を持つ配列を返すことです。

使用法:

my @values= $feature->get_tag_values('go');

さようなら!

于 2012-09-24T11:16:15.033 に答える