SQLAlchemyは、関係がフィルターで使用されている場合を理解していません。あなたの例ではorder.events.corporate。
そうしようとすると、次の例外が発生します。
AttributeError: Neither 'InstrumentedAttribute' object nor 'Comparator' object associated with Order.events has an attribute 'corporate'
SQLAlchemyRelationshipsのドキュメントページで説明されているAssociationObjectパターンの使用を検討することをお勧めします。
したがって、クエリは次のようになります。
session.query(Order).filter(and_(EventsAssoc.type=="corporate",Event.name=="Big Corporation"))
スキーマを定義してオブジェクトを作成する方法の完全な例を参照してください。
from sqlalchemy import *
from sqlalchemy import create_engine, orm
from sqlalchemy.ext.declarative import declarative_base
from sqlalchemy.orm import relationship
metadata = MetaData()
Base = declarative_base()
Base.metadata = metadata
class Event(Base):
    __tablename__ = 'event'
    id                  = Column(Integer, Sequence("event_seq"), primary_key=True)
    name                = Column(String(32))
    def __repr__(self):
        return "%s(name=\"%s\",id=\"%s\")" % (self.__class__.__name__,self.name,self.id)
class EventsAssoc(Base):
    __tablename__ = 'events'
    id                  = Column(Integer, Sequence("events_seq"), primary_key=True)
    left_id = Column(Integer, ForeignKey('order.id'))
    right_id = Column(Integer, ForeignKey('event.id'))
#    order_id            = Column(Integer, ForeignKey('order.id'), primary_key=True)
#    event_id            = Column(Integer, ForeignKey('event.id'), primary_key=True)
    type                 = Column(Enum('corporate', 'personal', name='enum_ev_type'))
    event = relationship(Event, backref="order_assocs")
    def __repr__(self):
        return "%s(events=%r,id=\"%s\")" % (self.__class__.__name__,self.event,self.id)
class Order(Base):
    __tablename__ = 'order'
    id                  = Column(Integer, Sequence("order_seq"), primary_key=True)
    name = Column(String(127))
    events = relationship(EventsAssoc)
    def __repr__(self):
        return "%s(name=\"%s\",id=\"%s\")" % (self.__class__.__name__,self.name,self.id)
db = create_engine('sqlite:////temp/test_assoc.db',echo=True)
#making sure we are working with a fresh database
metadata.drop_all(db)
metadata.create_all(db)
sm = orm.sessionmaker(bind=db, autoflush=True, autocommit=True, expire_on_commit=True)
session = orm.scoped_session(sm)
o = Order(name="order1")
ea_corp = EventsAssoc(type="corporate")
ea_corp.event = Event(name="Big Corporation")
ea_pers = EventsAssoc(type="personal")
ea_pers.event = Event(name="Person")
o.events.append(ea_corp)
o.events.append(ea_pers)
session.add(o)
session.flush()
query = session.query(Order).filter(and_(EventsAssoc.type=="corporate",Event.name=="Big Corporation"))
for order in query.all():
    print order
    print order.events
sqlalchemyによって生成されたクエリは次のとおりです。
SELECT "order".id AS order_id, "order".name AS order_name 
FROM "order", events, event 
WHERE events.type = ? AND event.name = ?
('corporate', 'Big Corporation')
PS EventsAssocオブジェクトへの直接アクセスがオプションになるようにアソシエーションオブジェクトパターンを拡張するために、SQLAlchemyはアソシエーションプロキシ拡張機能を提供します