残念ながら、AzureにはEF 5空間サポートがないという問題があるため、関連するDLLを自分で含める必要があります:関連リンク
SqlServerSpatial.dllを含めると、VisualStudio内の公開ツールを使用して正常に展開を完了することができました。
ただし、関連するDLLをgithubreproで使用できる状態でGithub->Azureデプロイメントを使用しようとすると、デプロイメントが失敗し、次のメッセージが表示されます。
The process cannot access the file 'C:\DWASFiles\Sites\<my app name>\VirtualDirectory0
\site\wwwroot\bin\SqlServerSpatial.dll' because it is being used by another process.
ここからトラブルシューティングする方法がよくわからないので、助けを借りることができます。ありがとう!