LINQ to XML では、これは非常に簡単です。
var classToRemove = "highlights-tracker";
var xml = XDocument.Parse(svg);
var elements = doc.Descendants("path")
.Where(x => x.Attribute("class") != null &&
x.Attribute("class")
.Value.Split(' ')
.Contains(classToRemove));
// Remove all the elements which match the query
elements.Remove();
XML の解析に正規表現を使用しないでください... XML は既存の API によって非常にうまく処理され、正規表現は適切なツールではありません。
編集: 形式が正しくない場合 (最初に言うべきでした) 、他の処理を行う前に、形式が正しくない理由を調べて修正する必要があります。最近では、XML の形式が正しくないことを言い訳にすることはできません... 存在するほぼすべてのプラットフォーム用の優れた XML API がたくさんあります。