私のマシン (Mac) でスタンドアロンの ncbi-blast-2.2.28+ を実行しようとしていますが、SwissProt データベースで blastp を実行すると、次のエラー メッセージが表示されます。
BLAST Database error: Could not find volume or alias file (nr.00) referenced in alias file (/Users/me/bin/db/swissprot.00).
ここで私がしたこと:
1) ncbi サーバーから「ncbi-blast-2.2.28+-universal-macosx.tar.gz」をダウンロードして解凍
2) フォルダーの bin コンテンツを $PATH ディレクトリ "/Users/me/bin" に移動します。
3) "/Users/me/bin" に "db" フォルダーと、次のパスを含む ".ncbirc" ファイルを作成しました。
[BLAST]
BLASTDB=/Users/me/bin/db
4) SwissProt データベースをダウンロードし、「/Users/me/bin/db/」に次のファイルを取得しました。
swissprot.00.msk
swissprot.01.msk
swissprot.02.msk
swissprot.03.msk
swissprot.04.msk
swissprot.05.msk
swissprot.06.msk
swissprot.07.msk
swissprot.08.msk
swissprot.09.msk
swissprot.10.msk
swissprot.00.pal
swissprot.01.pal
swissprot.02.pal
swissprot.03.pal
swissprot.04.pal
swissprot.05.pal
swissprot.06.pal
swissprot.07.pal
swissprot.08.pal
swissprot.09.pal
swissprot.10.pal
swissprot.pal
次に、次のコマンドを使用して、任意の作業ディレクトリ (クエリ ファイルがある場所) から blastp を実行すると、次のようになります。
blastp -query input.fasta -db swissprot
次のエラー メッセージが表示されます。
BLAST Database error: Could not find volume or alias file (nr.00) referenced in alias file (/Users/me/bin/db/swissprot.00).
他のスレッドで読んだように、コマンドラインでデータベースが配置されているパス全体を言及し、ファイル名から .pal 拡張子を削除しようとしました。しかし、まだ機能しません。
誰かが私が間違ったことを見ることができますか?!!!!