Windows 7 で実行されている R および R2WinBUGS を使用して、WinBUGS でいくつかのシミュレーションを実行しようとしています。
すべてのファイルを準備し、関数 bugs() を起動した後、WinBUGS ウィンドウは開きますが、シミュレーションは開始されません。古いバージョンの R や OpenBUGS でも同じことが起こります。Windowsの問題ですか?
コードは次のとおりです。
N <- 1000 #Number of simulations
S <- 100 #Number of sites
Phi <- .4 # Occupancy probability
Occ <- array(NA, dim=c(N, S))
for (n in 1:N){
Occ[n,] <- rbinom(S, 1, Phi)
}
# Model
sink("W.txt")
cat("
model {
# priors
psi ~ dunif(0, 5)
#Model
for (i in 1:nsite) {
#Ocupation model
Z[i] ~ dbern(psi)
}
}# end of model
",fill = TRUE)
sink()
library(R2WinBUGS)
# MCMC settings
ni <- 1000
nt <- 5
nb <- 500
nc <- 5
# Parameters monitored
params <- c("psi")
#Bundle data
data <- list(Z=Occ[1,])
#Initial values
inits <- function(){list(psi =runif(1, 0, 5))}
#Lunch WinBUGS
Bugs <- bugs(data, inits, params, "W.txt", n.chains = nc, n.thin = nt, n.iter = ni, n.burnin = nb, debug=T, working.directory = getwd(), save.history=T)
print(Bugs, dig=3)
どんな助けでも大歓迎です!乾杯マリオ