私は多変量統計の初心者なので、この質問がナイーブであったり、何か重要なことを見逃していたりした場合は、ご容赦ください。
アドニス使用時のバランスの悪いデザインの対処法を知りたいです。ストリームの堆積物に存在する微生物群集のデータセットと、ストリーム (4 レベル)、US_DS (2 レベル)、およびシーズン (2 レベル) の因子があります (他の因子もありますが、今のところこれらに固執しています)。たとえば、以下のコード:
dist.L2<-vegdist(L2, mehod=”bray”)
adonis(dist.L2~Season*Stream*US_DS, data=factors, permutations=199)
残念ながら、設計は不均衡です (複製が 1 つしかないサイトもあれば、最大 3 つあるサイトもあります)。
adonis を実行してみましたが、anodis はタイプ 1 の SS を使用するため、要素を配置する順序によって大きな違いが生じます。1 つの要素を他の要素の前に配置する理由はありません。他の統計パッケージはタイプ II またはタイプ III の二乗和を使用することでこれを回避していること、および使用する SS のタイプに関係なく長所と短所があることを私は知っています。私のデータの性質上、他のより単純な統計テストは実際には適切ではありません。
アドニスでタイプ III のエラーを使用する方法、または適切なテストを見つけるためにタイプ I のエラーとアドニスをそのまま使用する手順があるかどうかを知りたいです。ありがとう