.sif (simple interaction)遺伝子発現値と遺伝子名のみを含む遺伝子マイクロアレイ発現 .tab ファイルからファイルを生成する方法は? Expander ソフトウェアと MeV を使用しており、 の入力ファイルを作成したいと考えていますCytoscape and Spike software。その目的のためのRパッケージまたは特定のプラグインまたはソフトウェアはありますか?
事前に計算された遺伝子間の相関に基づいて、手動で .sif ファイルを作成できます。
CD31 pp CD34
BRCA pp CD31
VEGF pp CD34
ただし、他のメトリックを使用して自動的に生成する方法はわかりません。
ありがとう