私はRに比較的慣れていないので、データフレームを繰り返し構築する最も効率的な方法を考えていました(一度に1行、繰り返し回数「n」、各行の長さ「l」は事前にわかっています)。
- 空のデータフレームを作成し、反復ごとに行を追加します
- nxlデータフレームを事前に割り当て、反復ごとに行を変更します
- nxl行列を事前に割り当て、反復ごとに行を変更し、行列からデータフレームを作成します
- 他の何か
事前割り当て!!!
matrix
また、データがすべて同じ型の場合はa を使用します。よりもはるかに高速になりますdata.frame
。
例えば:
> n <- 1000 # Number of rows
> row <- 1:20*1 # one row
>
> # Adding row, one-by-one
> Data <- data.frame()
> system.time(for(i in 1:n) Data <- rbind(Data,row))
user system elapsed
2.18 0.00 2.18
>
> # Pre-allocated data.frame
> Data <- as.data.frame(Data)
> system.time(for(i in 1:n) Data[i,] <- row)
user system elapsed
0.94 0.00 0.93
>
> # Pre-allocated matrix (fast!)
> Data <- as.matrix(Data)
> system.time({ for(i in 1:n) Data[i,] <- row; Data <- as.data.frame(Data) })
user system elapsed
0 0 0
最初にリストから必要な列タイプを事前に割り当ててみませんか?
as.data.frame(list(a1 = vector("numeric", n), a2 = vector("character", n)))