Xeon プロセッサを搭載した 2 ノード クラスタに Linpack をインストールしました。次のコマンドで Linpack を起動すると、次のようになります。
mpiexec -np 28 -print-rank-map -f /root/machines.HOSTS ./xhpl_intel64
linpack が開始され、出力が出力されます。出力された mpi マッピングのみが表示され、その後何も表示されないことがあります。呼び出しの間に何も変更しないため、これはランダムな動作のように思えます。すでに述べたように、Linpack は起動する場合と起動しない場合があります。プロセスが作成され、CPU を大量に使用しているtopことがわかりますが、ノード間のトラフィックを監視すると、何も送信されていないことがわかります。xhpl_intel64iftop
MPI 実装として MPICH2 を使用しています。これは私の HPL.dat です:
# cat HPL.dat
HPLinpack benchmark input file
Innovative Computing Laboratory, University of Tennessee
HPL.out output file name (if any)
6 device out (6=stdout,7=stderr,file)
1 # of problems sizes (N)
10000 Ns
1 # of NBs
250 NBs
0 PMAP process mapping (0=Row-,1=Column-major)
1 # of process grids (P x Q)
2 Ps
14 Qs
16.0 threshold
1 # of panel fact
2 PFACTs (0=left, 1=Crout, 2=Right)
1 # of recursive stopping criterium
4 NBMINs (>= 1)
1 # of panels in recursion
2 NDIVs
1 # of recursive panel fact.
1 RFACTs (0=left, 1=Crout, 2=Right)
1 # of broadcast
1 BCASTs (0=1rg,1=1rM,2=2rg,3=2rM,4=Lng,5=LnM)
1 # of lookahead depth
1 DEPTHs (>=0)
2 SWAP (0=bin-exch,1=long,2=mix)
64 swapping threshold
0 L1 in (0=transposed,1=no-transposed) form
0 U in (0=transposed,1=no-transposed) form
1 Equilibration (0=no,1=yes)
8 memory alignment in double (> 0)
編集2:
プログラムをしばらく実行すると、30分後に次のように表示されます。
# mpiexec -np 32 -print-rank-map -f /root/machines.HOSTS ./xhpl_intel64
(node-0:0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15)
(node-1:16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31)
Assertion failed in file ../../socksm.c at line 2577: (it_plfd->revents & 0x008) == 0
internal ABORT - process 0
APPLICATION TERMINATED WITH THE EXIT STRING: Hangup (signal 1)
これはmpiの問題ですか？
これがどのタイプの問題であるか知っていますか？