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ワークフローの DAG を D3.js 互換の JSON 形式でエクスポートしたいと考えています。

snakemake.snakemake(snakefile=smfile,
                    dryrun=True,
                    forceall=True,
                    printdag=False,
                    printd3dag=True,
                    keepgoing=True,
                    cluster_config=cluster_config,
                    configfile=configfile,
                    targets=targetfiles)

残念ながら、入力ファイルが見つからないと文句を言います。

ファイルが見つからないという事実については正しいですが、特にkeepgoingオプションをTrue.

入力ファイルなしで DAG をエクスポートするスマートな方法はありますか?

ありがとう、ジャン

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