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snakemake - Snakemake: d3dag のエクスポート - MissingInputException
ワークフローの DAG を D3.js 互換の JSON 形式でエクスポートしたいと考えています。
残念ながら、入力ファイルが見つからないと文句を言います。
ファイルが見つからないという事実については正しいですが、特にkeepgoing
オプションをTrue
.
入力ファイルなしで DAG をエクスポートするスマートな方法はありますか?
ありがとう、ジャン
python - Python と VTK を使用してセグメンテーション MRI ファイルからメッシュ サーフェスを作成する方法
nifti 形式の 3D 医用画像のバイナリ マスク「mask.nii.gz」があり、そこからサーフェス メッシュを抽出します。
次のように、バイナリ マスク データを numpy.ndarray にロードできます。
上記の image_data を使用して vtkDiscreteMarchingCubes() でサーフェスをレンダリングし、レンダリングされたサーフェスから頂点を出力する方法がわかりません。
誰かがこの問題に光を当てることができますか? 申し訳ありませんが、私はここの VTK ライブラリに非常に慣れていません。よろしくお願いします。