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非常に基本的な質問で申し訳ありませんが、これを理解することはできません:

セルの 20 の異なるグループを持つ Seurat オブジェクトがあります (すべてメタデータで定義され、active.identとして設定されます)。そのうちの 10 は「処理済み」で、10 は「未処理」です (この情報はメタデータにもあります)。

Rスーラパッケージ

一度に 1 つのグループを強調表示する DimPlot を作成しようとしていますが、「処理済み」と「未処理」の色は異なるはずです。

私の作業コードは、「処理済み」と「未処理」の両方を同じ色で強調表示します。

DimPlot(integrated, label = T, group.by = "Treat", 
        cells.highlight = WhichCells(integrated, 
                                     idents = c("group1_untreated", "group1_treated")), 
        cols.highlight = c("darkblue", "darkred"), cols = "grey")

それを行う正しい方法は何ですか？

どんな提案でも大歓迎です！

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