クラスターに基づいて anndata をサブセット化したいのですが、その方法がわかりません。
私は scVelo パイプラインを実行しています。そのtl.louvain中で、louvain に基づいてセルをクラスター化する関数を実行しました。約 32 個のクラスターがあり、そのうちクラスター 2 と 4 に興味があり、これらのクラスターでのみパイプラインをさらに実行する必要があります。(最初は scVelo で読んだ織機ファイルを持っていたので、現在は anndata を持っています。)
これを使用しadata.obs["louvain"]てクラスター情報を取得しようとしましたが、2 つのクラスターのみで新しい anndata を作成し、さらに処理する必要があります。
データをサブセット化する方法を教えてください。どんな助けでも大歓迎です。（初心者なのでなかなか手に入らないと思います）