igragh を使用して、ローカル推移性と Barrat 推移性の出力を比較してみます。ただし、有向グラフの計算方法に問題があります。結果は私が期待したものとは異なるようです。
ローカル推移性を計算する場合、方向は無視されます。閉じたトライアドの数を考えられるすべてのトライアドで除算して、ローカル推移性を計算しました (Wasserman & Faust, 1994 を参照)。しかし、結果は 0.1666667 NaN NaN 1 1 で、Barrat 推移性の出力と同じです。誰か親切に説明してくれませんか?
以下はコードと出力です。
g_1 <- graph( edges=c(1,2,1,3,1,4,1,5,4,1,5,1,4,5), n=5, directed=T)
transitivity(g_1, type="local", isolates = "NaN")
#[1] 0.06666667 NaN NaN 0.33333333 0.33333333
transitivity(g_1, type="Barrat", isolates = "NaN")
#[1] 0.1666667 NaN NaN 1.0000000 1.0000000