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2因子のキューブプロットを生成できるRパッケージはありますか? このページの最後にある最初のプロットに似たものが欲しい http://www.processma.com/resource/factorial_plots.htm

Minitab でこのようなプロットを取得することができます。

パッケージ FrF2 にはコマンド cubeplot がありますが、3 因子のみです。

もちろん、2 つの同一の要素を使用できますが、(立方体ではなく) 素敵な正方形の画像が必要です。

被験者の 2 つの不均衡なグループ (G) を比較したい: 独立変数は因子 A と B、従属変数は因子 C です。

教授からタイプ 3 の SS ANOVA を使用するように言われましたが、次が正しいかどうかわかりません。

注:すべての被験者が A と B のすべてのレベルを行ったため、 と も被験者の範囲内です。A(グループ) は被験者の間です。サブジェクト ID です。データ セットはです。BGSubjectmydata

列 1 (領域) に解剖学的領域、列 2 (S1) に遺伝子発現値を含むデータフレームに対して ANOVA と TukeyHSD を実行しました。通常、aov サマリーの p 値はPr(>F)として表現されると予想されるため、取得した結果については少しあいまいです。また、誰かが平均結果のTukey多重比較を理解するのを手伝ってくれますか? diffとp adjの結果が何を示しているかは完全にはわかりません。ここに示されている結果は、私が実際に作業しているものの要約版です。参考までに。

階乗 ANOVA を実行した後、TukeyHSD事後検定を行いました。TukeyHSD出力から調整された P 値の一部は0.0000000です。これらの P 値は本当にゼロになるのでしょうか? または、これは丸めの状況であり、私の真の P 値は 1e-17 のようなもので、丸められて0.0000000.

TukeyHSD()指数を含む出力 P 値を与える R の関数のオプションはありますか?

ここに私の出力のスニペットがあります:

次の線形モデルの ANOVA の Greenhouse-Geisser-Epsilon (二次形式の分布のボックス近似に基づく) を計算します。

car や ez などの R パッケージを使用して、上記の anova で使用される検定統計量のおおよその分布の GG-Epsilon を取得する方法はありますか。

次の ANOVA で使用される検定統計量の分布の GG-Epsilon を取得する方法しか知りません。

しかし、この検定統計量は、最初の例で anova 関数によって使用された統計量とは異なる 2 次形式で構成されています。

組み込みパッケージを使用して R で ANOVA を作成する必要があります。データは次のようになります。

aとbは、変数によって割り当てられたグループの平均値が等しいかどうかについて仮説をテストしたいc変数です。t-test私のケースは、十分でない場合の最も単純なケースです。

ANOVA 方法で分析したいシミュレーションを実行していますが、その設定方法を理解するのに問題があります。

私は 2^5 要因計画を持っているので、32 の可能な組み合わせを概説する適切な +/- 値を使用して実験を 32 回実行します。

ただし、組み合わせごとに約 500 の複製もあります。シミュレーションを通じてデータを収集しているので、組み合わせごとに 500 回の異なる実行があります。

これにより、500 個の応答値の 32 個のベクトルが得られます。また、5 つの異なる因子として使用されるすべての +/- 値を保存する計画行列/ベクトルもあります。

これは、複製がなければ比較的簡単だと思います（因子の因子変数を作成し、モデルを適合させて分散分析などを行います）が、複製を処理するためにデータマトリックスをどのように設定する必要があるかについて混乱しています。データに 500x32 の行列を使用する必要がありますか? 回答の平均を取りますか?

ありがとう