問題タブ [genomicranges]

はるかに長く複雑なクエリの一部として、重複する間隔のエントリを 1 つだけ保持し、重複しないすべてのエントリを保持しようとしています。最小限の例を次に示します。

エントリ 2 と 3 は同じ id で範囲が重複しています (一方の開始と終了は他方に含まれています) が、 と は異なりcutoffますseq_region。エントリ #3 は、実際にはエントリ #2 の部分文字列です。私がSQLに入れることができないのは条件です：

• 同じ seqid の 2 つの範囲が重複する場合は、スコア == 0.75 (または、これらの属性が結合されているため、最長の seq_region) を持つ範囲を選択します。

目的の出力は、エントリ #1 と #2 である必要があります。

これをSQLクエリとしてどのように配置するのですか? オーバーラップ条件では、一方の間隔が常に他方の間隔に含まれていると想定できます (開始または終了は同じである可能性があります)。問題があれば、それは SQLite3 データベースです。

これにはある種の自己内部結合、または操作によるグループ化を行う必要があると思いますが、うまくいきません。ご意見をお待ちしております。