問題タブ [ggdendro]

デンドログラム用のこのコードがあります。デンドログラム (または y 軸) のサイズを小さくするにはどうすればよいですか?

このコードを例として使用しています。私のデータセットには大きなラベルがあるため、ラベルを含めるのに十分なスペースがありません。そのため、y 軸に使用するスペースを減らし、距離を 0 から 150 の間で減らしたいと考えています。また、図を tiff として保存すると、ほとんどの図が樹形図になり、ラベルがはっきりと見えなくなります。

このヒートマップと同様にデンドグラムのサイズを小さくするにはどうすればよいですか?

_{(出典: r-graph-gallery.com )}

本当にありがとうございます

私は系統樹を持っています：

ggdend次に、オブジェクトに変換します。

my.dendを使用ggplot2してプロットし、葉の円グラフに追加したいと思います。

data.frame各リーフのパイを説明する は次のとおりです。

my.dendのプロットとのlabels.df使用を組み合わせるとうまくいくと思いました。scatterpiegeom_scatterpie

私もです：

これにより、次のことが得られます。

最後に追加+coord_flip()する場合：

パイは歪みませんが、ツリーは反転して垂直になり、根が下を向きます。

パイを歪ませず、根を左側にして木を水平にする方法はありますか?

解釈するには多すぎることがわかっているため、より少ないクラスターにカットしたい樹形図があります。私のデータフレームは次のようになります。

alphacut <- cutree(alpha.dendro, h=3)

cutree(alpha.dendro, h = 3) のエラー:

'tree' が正しくありません (composante 'merge')

alphacut <- cutree(as.dendrogram(hclust(d = dist(x = alpha.matrix), method="complete" )), k=5)

cutree(as.dendrogram(hclust(d = dist(x = alpha.matrix), method = "complete")) のエラー:

'tree' が正しくありません (composante 'merge')

私はこれに対する解決策を見つけていません。「alpha.dendro」を見ると、2 つのリストがありますが、マージ コンポーネントがないため、これが問題のようです。誰かが何をすべきか知っていますか？