問題タブ [dendextend]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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r - 2 つのデンドログラム (R) 間の「類似性」をどのように比較しますか?

2 つのデンドログラムがあり、それらがどの程度「似ている」かを調べるために比較したいと考えています。しかし、私はそうする方法を知りません(Rでそれを実装するコードは言うまでもありません)。

リードはありますか?

更新(2014-09-13):

この質問をして以来、デンドログラムの視覚化、操作、および比較のために、 dendextendという R パッケージを作成しました。このパッケージはCRANにあり、詳細なビネットが付属しています。、、/などの関数が含まれます。2 つのツリーを視覚的に比較するための関数と同様。cor_copheneticcor_bakers_gammaBkBk_plottanglegram

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r - 樹状図の葉を変更する

hclustオブジェクトのプロットから生成された樹状図の葉のプロパティを変更したいと思います。最低限、色を変えたいのですが、ご協力いただければ幸いです。

私は答えをグーグルで検索しようとしましたが、私が見たすべての解決策は、私が推測したものよりもかなり難しいようでした。

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r - カット デンドログラムのターミナル ノードにラベルを付けるにはどうすればよいですか?

次のコードを使用して、デンドログラムを特定の高さでカットしました。問題は、デンドログラムをカットするときに、ノードにラベルを追加する方法がわからないことです。ラベル付きのデンドログラムをカットするにはどうすればよいですかRプログラムを使用していますか?

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r - 色付きの枝を持つ樹状図を作成するには?

以下に示すように、色付きの枝を持つ樹形図をRで作成したいと思います。 ここに画像の説明を入力

これまでのところ、次のコマンドを使用して標準のデンドログラムを作成しました。

目的の結果を得るには、このコードをどのように変更すればよいですか?

よろしくお願いします。

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r - ラベルと色の葉の樹形図

私のサンプルには5つのグループコードがあります(サンプル名/種/などとして機能しますが、繰り返します)。

したがって、ヘルプが素晴らしいという2つの問題があります。

  • (サンプル番号の代わりに) リーフ ラベルにグループ コードを表示するにはどうすればよいですか?

  • 各コード グループに色を割り当て、それに応じてリーフ ラベルに色を付けたいと思います (それらが同じクレードに属さず、それによって詳細情報を見つけることができる場合があります)。

私のスクリプトでそうすることは可能ですか (ape または ggdendro):

read.table を置き換えるランダムなデータフレーム:

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r - ggplot2 を使用してデンドグラムのクラスターを色付けする

Didzis Elferts は、ggplot2 と ggdendro を使用してデンドグラムをプロットする方法を示しました。

ラベル付きのRの水平デンドログラム

コードは次のとおりです。

さまざまなクラスターに色を付ける方法を知っている人はいますか? たとえば、2 つのクラスター (k=2) を色付けしたいですか?