問題タブ [ggdendro]
For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.
r - ggplot2で格子樹状図グラフを再現
この格子プロットをggplot2で再現することは可能ですか？
r - ggdendro を使用してデンドログラムのセグメントの下に変数ラベルを表示する
私の質問は、私の以前の質問に対するAndrie の回答に関連しています。私の質問は、デンドログラムの対応するセグメントの下に変数ラベルと車のラベルを表示できるかどうかです。
r - ggdendrogram プロットの反転
私は ggdendrogram を使用してデンドログラムをプロットしていますが、グラフをより直感的にするために左側にラベルを付けたいと考えています。どうすればいいですか？ありがとう！！！
r - ggdendrogram でデンドログラムを作成する
クラスター分析を行って樹形図を作成しています。パッケージを使用ggdendrogramしましたが、その出力を で使用したいと考えていますggplot2。リーフラベルと同じxラベルをどのように取得するのだろうか。ありがとう
r - ggplot2 および ggdendro - ノードの葉の下にカラー バーをプロットする
現在、樹状図をプロットするためにggplot2とを使用しています。ggdendroしかし今、ラベルとともに葉の下に離散変数をプロットする必要があります。
たとえば、ある出版物 (Zhang et al., 2006) で、次のような系統樹を見ました (葉のラベルの下にあるカラー バーに注目してください)。
すでにビニングしたデータを使用して、ggdendro + ggplot2 で同じことを行うことに興味があります。これは可能ですか？
r - ggplot2 を使用してデンドグラムのクラスターを色付けする
Didzis Elferts は、ggplot2 と ggdendro を使用してデンドグラムをプロットする方法を示しました。
コードは次のとおりです。
さまざまなクラスターに色を付ける方法を知っている人はいますか? たとえば、2 つのクラスター (k=2) を色付けしたいですか?
r - R の水平樹状図のクラスターの周りのツリー カットと四角形
Rクラスターを識別する長方形を使用して、階層的クラスタリングの結果をデンドログラムとしてプロットしようとしています。
次のコードは、垂直樹状図のトリックを実行しますが、水平樹状図 ( horiz=TRUE) の場合、長方形は描画されません。水平デンドログラムでも同じことを行う方法はありますか。
さらに、希望の距離値で木を切るための線をプロットしたいと思います。Rでそれをプロットする方法.cutree関数はクラスターを返しますが、それをプロットすることも可能です.
私が探している望ましい出力はこのようなものです。
Rでこれを行うにはどうすればよいですか?
r - ggdendrogram は、plotly で使用するために右側に ggplot 軸ラベルを付けて回転します
Rでggplot2（より具体的ggdendro::ggdendrogramには）を使用して適切なデンドログラムを生成しようとしています。これは、協力者とプロットで共有したいためです。現在、APIでプロットでデンドログラムを生成することはできないと思います。
樹状図を回転させると、主に「軸」のラベル付けに問題があります。
これにより、目盛りラベルが間違った側にある次のプロットが得られます。
実行時にRベースグラフィックスと同様の結果を得たいplot(as.dendrogram(hc),horiz=TRUE)
おまけとして、葉 (目盛り) ラベルを個別に色付けしたり、描画のrect.hclustようなボックスを作成したりしたいのですが、これは厳密には必要ではありません。私は ggplot2 構文について少し知っているので、考えられるすべての解決策を長々と説明する必要はありません。
関連する場合は、以下を見つけてくださいsessionInfo()。Ubuntu 12.04 LTS サーバーで Rstudio サーバーを介して R を使用しています。
r - ガイドが geom_text 内で定義されている場合の凡例記号の変更
ここに私のデータがあります：
グループ因子を追加します
次のコード
このプロットを生成します：
追加するとき
タイトルが変更され、凡例キーのサイズが変更されますが、形状引数は無視されます:
何故ですか？
ありがとうございました！
r - デンドログラムからクラスターを切り出す
このリンクを使用して、カテゴリごとに色付きのラベルが付いた素敵な樹状図をプロットしています。2番目の答えは、以下のコードを使用するこのリンク（ Rの水平デンドログラムのクラスターの周りのツリーカットと長方形）で私が見ているものです：
16個のクラスターがあり、145個のラベルがあるため、クラスターの一部を切り取って、それらのいくつかにのみ焦点を合わせ/切り取り/ズームインしたいので、いくつかのクラスターのみを表示できるようにします.何か方法はありますか?これは hclust オブジェクトにあります。これは、145 個のラベルで図が乱雑になるため、見栄えを良くするためだけのものです。ラベルごとに色を付けたいので、ggdendro はかなり適していると思います。
たとえば、このリンクでは、3) デンドログラムの拡大http://gastonsanchez.com/blog/how-to/2012/10/03/Dendrograms.htmlを見れば、