問題タブ [lsmeans]

ここにコードサンプルがあります

confint 関数にかかる時間は次のとおりです。

confint.default を使用してみましたが、エラーが発生します

Error: $ operator not defined for this S4 class

私の実験では、植物を刈り取り、シーズンの終わりに生産される葉の量などの反応を測定しました。クリッピング強度とクリッピング時間の両方を操作し、これら 2 つの処理を交差させました。私はまた、5つの異なるクリッピング処理の組み合わせをもたらすコントロールのクリッピング処理を含めました. 治療ごとに12の植物で、合計60の植物があり、2年間追跡しました. つまり、1 年目にこれら 60 の植物の測定値を収集し、2 年目に同じ植物を再度収集しました。

これが私のデザインです。タイミングの下で​​は「決して」、強度の下では「ゼロ」が任意に「コントロール」処理に取って代わりました。

Ben Bolker の 1 つの提案に従い、lme4 の実行による警告を無視し、その後、モデルに対して F 検定を実行しました ( R- analysis 繰り返し測定の不均衡な設計を lme4? で実行しましたか? )。

anova の出力から、タイミングと強度の間に有意な相互作用が得られました (p=0.006)。次に、以下を使用して多重比較テストを行いました。

これは、p=0.08 の唯一の重要なペアを含む出力のクリップです。

Anova がタイミング*強度を非常に有意であると見なしたのに、多重比較検定で有意性が示されないのはなぜですか? 多重比較を行うべき別の方法はありますか?

他の多重比較出力では、p 値が 1.00000 にもなりますが、これは正常ですか?

PS。私は一生、このバランスの取れていない設計で lsmeans を動作させることができませんでした。多くの NA が出力で報告されます。

次のように、lsmeans を使用して線形混合効果モデルを実行するとします。

3つのレベルを持つ「A」の重要な主効果を見つけたところ。次に、「lsmeans」パッケージを使用して 3 つのレベルを比較する事後テストを実行しました。

Aのレベルを比較するときに、この事後比較でもランダム係数「C」が考慮されるのでしょうか?

lsmeans ライブラリを読み込もうとしています。

次のメッセージを取得します。

library(lsmeans) # for lsmeans 必要なパッケージを読み込んでいます: 推定可能性

次にインストールしました

install.packages("推定可能性")

しかし、完了した後でも、このライブラリを実行すると同じメッセージが表示されます。

library(lsmeans) # for lsmeans 必要なパッケージを読み込んでいます: 推定可能性

何か案は？

ありがとう