問題タブ [mahotas]

こんにちは私はPythonを初めて使用し、Pythonイメージチュートリアルに従っています。

チュートリアルで説明されているパッケージをインストールした後、以下はエラーなしで実行されます

しかし、画像を読んでみると

私は得る

image = mahotas.imread（'image_file.jpg'）トレースバック（最後の最後の呼び出し）：ファイル ""、行1、ファイル "/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/mahotas-0.6.4 -py2.6-linux-i686.egg / mahotas / init .py "、68行目、imread raise ImportError（'mahotas.imreadはfreeimageに依存しています。見つかりませんでした。エラーは次のとおりです：％s'％e）ImportError： mahotas.imreadはfreeimageに依存しています。見つかりませんでした。エラーは次のとおりです。mahotas.freeimage：次のディレクトリのいずれにもlibFreeImageが見つかりませんでした：'/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/mahotas-0.6.4-py2.6-linux-i686.egg/ mahotas'、' / lib'、' / usr / lib'、' / usr / local / lib'、' / opt / local / lib '

私はFreeImagePyをインストールしてみましたが、問題なくインポートできますが、役に立ちません。パッケージsysを使用してPythonパスに追加しようとしましたが、どちらも役に立ちません。

編集：pymorphとmahotasをダウンロードして' sudo python setup.py install 'を実行することでインストールされている間に、pymorphとmahotasを除くすべてのパッケージが'* sudo apt-get installpackage_name*'を実行してLinuxボックスにインストールされたことを述べておく必要があります。

マホタスで画像を書こうとしていますが、妙に難しいと思います。

私が得ているエラーは次のとおりです。

私はOSXを使用しており、brewを使用してfreeimageをインストールしました。

最近、Python で多くのビジョン関連の作業を行う必要があり、フォーマットを切り替えるのに多くの困難に直面しています。Mahotas を使用して画像を読み取ると、両方とも numpy.ndarray を使用しているにもかかわらず、cv2 に変換できないようです。SimpleCV は OpenCV イメージを簡単に取得できますが、レガシー cv または mahotas 用に SimpleCV イメージを取得するのはかなりの作業のようです。

いくつかのフォーマット変換構文は本当にありがたいです。たとえば、mahotas を使用してグレースケール画像を開くと、デフォルトで浮動小数点色空間として処理されます。型を numpy.uint8 として割り当てても、cv2 はそれを配列として認識できないようです。この問題を解決する方法がわかりません。カラー画像もあまり運がありません。Ubuntu Oneiric Ocelot で Python 2.7 32 ビットを使用しています。

前もって感謝します！

私の別のコードで保存された画像があります。画像は通常のJPGファイルです。imsaveで保存しました。

別のコードで読んでいると、3Dのようです:S

画像はこちらです。

それを読み取るための簡単なコードは次のとおりです。

医療画像で茶色のピクセル (血管) を選択 (しきい値) し、それらが表す領域を計算したいと考えています。Matlab や C++ のように Python でそれを行うにはどうすればよいですか? 私が見つけられなかった良い例はありますか？

ありがとうございました

1D numpy サブアレイの配列からサブアレイを選択する方法は?