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r - R言語:パッケージキャレットの関数rfeは混合効果モデルで使用できますか
rfe
R で混合効果モデルを使用して機能選択を行いたいのですが、パッケージ caret の機能とパッケージ me の機能を組み合わせることができませんnlme
。
以下は、機能するが混合効果モデルを使用しない例です。
そして、ここに私がやりたいことの概要があります:
そのようなことが可能かどうか、またそれを行う方法を知っていますか?
r - gls の相関パラメータがグループ化係数に依存することを許可する
以下は、私が遭遇している問題の MWE です。Orthodont
27人の子供(女の子16人、男の子11人)の4つの測定値で構成されるnlmeパッケージのデータセットを使用しています。相関をモデル化するために、 を指定して構造化されていない共分散構造を使用していcorrelation = corSymm(form = ~1|Subject)
ます。さまざまな測定機会にわたる非一定の分散を許可していますが、分散共分散パラメーターが男の子と女の子で異なることも許可したいと思います (たとえば、測定間の相関は女の子よりも男の子の方が高い/低いため) )。を指定することで、分散パラメーターのこの不均一性をweights = varIdent(form = ~1|age*Sex)
許可できますが、相関パラメーターのこの不均一性を許可または指定する方法を知っている人はいますか?
ステートメントでオプションをproc mixed
指定することにより、SASでこれが可能であることは知っています( http://support.sas.com/documentation/cdl/en/statug/63033/HTML/default/viewer.htm#statug_mixed_sect019.htm)が、私はRでこれに対処する方法を見つけていません。group
repeated
よろしくお願いします!
matlab - NLME を使用した Simbiology Population PK: 共変量の値が欠落していると、「有効な値がありません」というエラーが発生する
母集団 PK モデリングに MatLab Simbiology を使用する際のアドバイスをいただければ幸いです。
基本的に、人口適合 (NLME) メソッドを使用してパラメーターを適合させようとすると、「共変量 'カリウム' にはグループ ID '33' の有効な値がありません」というエラー/警告メッセージが表示されます。これは、被験者 33 のカリウム レベル (共変量) に欠損値があるためだと推測しています。
実際、いくつかの被験者のいくつかの共変量のデータが欠落しています!
私は MatLab の SimBio の使用に非常に慣れているので、値が欠落している場合に人口 PK モデルを大量生産する方法について、簡単な言葉で詳細なアドバイスをいただければ幸いです。ありがとう:)
r - 「オブジェクト」引数を anova() 関数に動的に渡す方法
lme4
またはnlme
パッケージを使用して、さまざまな線形混合効果モデルを比較するためのより柔軟なアプローチを可能にするスクリプトを書くのに苦労しています。追加または削除するモデルごとにスクリプトを調整したくないので、動的なアプローチを探しています。そうすることで、モデル式の文字列を含む 1 つの変数を調整するだけで済みます。
これは、適切なクラスを含む要素のリストを受け入れない限り、正常に機能anova()
します。anova()
anova()
リストを分解して複数の引数を関数に渡すきちんとした方法がわかりませんでした。unlist()
私は成功せずに試しました。
これは最小限の例です(lme4マニュアル、p。8から適応):
regex - 混合モデル式から項を削除する方法
かなり特定の正規表現の問題があり、悲しみを引き起こしています。lme
混合モデル ( または のいずれか)から 1 つまたは複数の固定効果lme4
を削除しました。対応するランダム勾配を削除したいと考えています。ただし、ランダム構造によっては、不要な+
シンボルが残ったり、さらに悪いことに、|
.
lme
からおよびlme4
を使用lme.model$call$random
してfindbars(formula(lme4.model))
それぞれ得られた変量効果式のリストを取得します。
変数を削除し、b
をc
使用して固定効果式から削除しましたdropterms
。それらは固定効果として存在しなくなったので、それらのランダムな勾配は変化することが許されるべきではありません。
b
次の行をc
使用して、上記のランダムな式から削除できます。
+
ここで、残りのシンボル、つまり変数をリンクしていないシンボルをすべて削除したいと思います。
~
次に、または(
との間に空白がある場合は、|
を挿入したいと思い1
ます。
望ましい出力は
いじりましgsub
たが、うまくいかないようです。たとえば、これは機能します:
しかし、これのためではありません:
代わりに、ランダム構造のような既存の関数があればdropterms
、私はオールインします!
同様に、またはの間1
の空白スペースにa を確実に挿入することはできません。~ |
( |