問題タブ [openbugs]
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bayesian - OpenBUGS - 変数が定義されていません
OpenBUGS で次のコードを使用して分析を実行しています。
次のエラーが表示されます: 変数 CD41[] が定義されていません。この問題を解決する方法がわからないので、助けていただければ幸いです。
r - modelCompile() 中のエラー [OpenBUGS]
2 つのグループ間でベイジアン NHST を実行しようとしています。各グループは多くの変数で構成されており、複数の仮説修正を避けるために、ベイズ法を選択しました。ただし、OpenBUGS の私のコードは次のエラーを出しています:
私は BRugs R パッケージを使用していますmodelCheck(...)
- モデルは構文的に正しく、modelData(...)
ロードされたデータは表示されますが、コンパイルしようとするとmodelCompile(..)
エラーがポップアップします。私は OpenBUGS の初心者です。
このエラーはどういう意味ですか??
winbugs - Openbugs 定数エラーが多すぎます
対数尤度式にゼロトリックを使用した以下のコードを実行しようとしています (phi は対数尤度です):
データ付き:
モデルは構文的に正しく、データはロードされていますが、次のエラーが発生しました:
誰でもその問題を解決するのを手伝ってもらえますか?
r - R の OpenBUGS エラー:「未定義の変数」
ライブラリ経由で R の OpenBUGS を使用して階層ベイジアン分析を実行しようとしていますR2OpenBUGS
が、モデル コンパイルの初期段階でエラー メッセージが表示され続けます。植物のサイズと環境の関数として、植物の機能特性をモデル化しようとしています。いくつかの植物種について、形質、胸の高さ (dbh) での直径、および標高に関するデータがあります。
私のモデルとデータ仕様は次のとおりです(データ生成部分を除く):
モデル化するパラメータの説明:
mu
: 種の平均s
: サイズ効果のパラメータenv
: 環境 (高度) 効果のパラメータme
: 各種の理論上の「最適」高度sig
: 分散で表される誤差項
データは行列tr.th
、dbh
、に格納されelevadj
、各行は各植物種を表します。私のデータは不均衡です: 種ごとに異なる数のサンプル ポイントが含まれています。は、各植物種の実際の (非) サンプル ポイントnp
の数を含むベクトルです。NA
(エラーを特定するために実際のデータが必要かどうかはわかりません。リクエストがあれば、ここにサンプルを投稿します)
このモデルを実行しようとすると、「変数 dbh が定義されていません」というエラー メッセージが表示され、コンパイルに失敗します。以前にモデルを正常に実行したことがあり、現在実行しようとしているモデルとそれほど変わらないため、これは非常に奇妙です。R で OpenBUGS を使用してベイジアン解析を開始してからまだ数週間しか経っておらず、いくつかの重要なポイントが欠けている可能性があるため、これはおそらく書式設定または仕様に関する単純でばかげた間違いだと思います。
サイトを見て、次の質問を見つけましたが、問題を解決するための申請に成功しませんでした:
マニュアルを読んでも役に立ちませんでした。次のテキストがありますが、あいまいすぎて理解できません。
'undefined variable' - リレーションの右辺で使用されない限り、モデルで未定義の変数を使用できます
RStudio バージョン 0.98.1091 と OpenBUGS バージョン 3.2.3 rev 1012 を使用しています。
誰かが問題の根本とそれを修正する方法を特定するのを手伝ってくれれば、とても感謝しています.
r - OpenBUGS の 'expected a comma' エラー
OpenBUGS を使用してモデルを適合させようとしています。コードは次のとおりです。
しかし、このコードを実行すると、「コンマが必要です」というエラーが表示されます。誰かがこの問題を解決するのを手伝ってくれるなら、それは素晴らしいことです。
r - OpenBUGS コードの奇妙なエラー (R2OpenBUGS を使用)
のパッケージOpenBUGS
を使用して、ワイブル サバイバル コードを作成しました。何時間もデバッグした後でも、以下のエラーが表示されます。R2OpenBUGS
R
ノードのこのコンポーネントは確率論的ではありません Beta0[1] エラー pos 30
ノードのこのコンポーネントは確率的ではありません Beta0[1] エラー pos 31
ノードのこのコンポーネントは確率論的ではありません Beta0[1] エラー pos 30
ノード アルゴリズムの更新エラー スライス アップデータ エラーでノードをサンプリングできません 反復回数が多すぎます
サンプラーが適応フェーズにあるときは推論できません
ここに私の完全なコードと初期値があります:
winbugs - R2OpenBUGS DIC を有効数字 4 桁に丸める
私は R2OpenBUGS を使用してさまざまなモデルを調べていますが、報告されたすべての DIC の有効数字が最大で 4 桁であることに気付きました。これは疑わしいと思われたので、DEBUG=TRUE に設定すると、DIC = pD + Dbar が丸められます。どうしてこれなの?DIC を丸めないように BUGS に指示することはできますか? DICを少なくとも一桁にしたい。
これがバグコールであり、以下は逸脱出力です。
out <- bugs(data1, inits=initial.values,parameters.to.save = c("err","b1","b0","pred365"), model.file = mymodel, n.chains = 1, n.iter = 25000、DIC=真、デバッグ=真)
ALS 31430.0 29700.0 33150.0 1723.0
合計 31430.0 29700.0 33150.0 1723.0