問題タブ [phyloseq]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

0 投票する
1 に答える
120 参照

r - phylosmith のインストールに失敗しました - 共有オブジェクト、未定義のシンボルを読み込めません

セットアップ: R バージョン 4.0.5 (2021-03-31) -- 「シェイク アンド スロー」 プラットフォーム: x86_64-pc-linux-gnu (64 ビット) Ubuntu 16.04

問題: phylosmith パッケージをインストールできません。指示:devtools::install_github('schuyler-smith/phylosmith', lib = "/home/dunfield/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.0/")

出力:

追加情報: 同様の問題を抱えた他の投稿を見たことがありますが、未定義のシンボルが異なります。このエラーは、指定された未定義のシンボル (_ZN3tbb10interface58internal9task_base7destroyERNS_4taskE) に固有のものだと思いますが、それが何に関係しているのか、または解決方法がわかりません。

ライブラリを変更して、.tar.gz ファイルから直接インストールしようとしました。私は GDAL バージョン 2.2.2 を持っていますが、私が持っている唯一のインストールだと思います。

インストールが完了する前にfinsihedフォルダーをコピーして、ライブラリに貼り付けることさえ試みました。パッケージ フォルダーが完成したようです。次に、コマンドを実行すると、次library(phylosmith)の出力が得られます。

指示に従って、事前にlinuxコマンドも実行しました。

端末コマンドapt install libtbb-devと R の TBB パッケージを使用してTBB をインストールしましたdevtools::install_package("jjallaire/TBB")。Linux と RStudio を再起動した後でも、どちらの試みもエラー出力を変更しませんでした。

この時点で、.so ファイルに tbb を含むシンボルと関係があることがわかりました。トラブルシューティングのヘルプをいただければ幸いです。