問題タブ [protein-database]

私はperlプログラミングに少し慣れていませんが、次のように定式化できるハッシュを持っています:

ハッシュの構造を要約すると、次のようになります。

このハッシュをいくつかの条件に従ってソートしたいと思います。最初に、タンパク質の総数が 100 を超える生物のみを考慮したいと思います。次に、生物の名前と最大のタンパク質とその長さを示したいと思います。

このために、私は次のアプローチをとっています。

ただし、これは生物の名前をタンパク質の総数と同じ数だけ出力します。たとえば、「snake」を 120 回出力します。その上、ソート行で変数 $org と $prot を使用する必要があると思うので、これは適切にソートされていません。

最終的に、出力は次のようになります。

dcd ファイルから水分子の時系列データを含むファイルを作成しようとしています。MDAnalysis モジュールまたは関数のいずれかを使用してこのデータを生成することは可能ですか? または、このファイルを生成するための Python スクリプトはありますか?

DCD ファイルを入力として使用して、2 つの列 (1 つは水分子の z 座標、もう 1 つはそれぞれの時間ステップ) を含むこのファイルを生成する必要があります。