問題タブ [r-markdown]

私の R Markdown ドキュメントでは、実際のコードを表示せずにレポートを生成したい場合があります (特に上司に送信する場合)。R コードを非表示にして、グラフと結果のみを表示するにはどうすればよいですか?

例えば：

これは、コマンドとプロットの両方を示しています。HTML レポートからコマンドを削除するにはどうすればよいですか?

RStudio でR スクリプト (.R) をRMarkdownファイル (.rmd) に変換し、「knit html」を押すと、2 つの出力ファイル (つまり、.html ファイルと .md ファイル) が生成されます。私は2つの問題に直面しています:

このhtmlファイルは、グラフのタイトルggplotが切り刻まれていることを示しています。元の幅 11 を新しい幅 15 に変更しました。

問題を解決するにはどうすればよいですか? また、.md ファイルを PDF ファイルに変換するにはどうすればよいですか?

R Markdown ファイル用の Jekyll コンバーターを作成しようとしています。作成してディレクトリRMarkdownConverter.rbに配置しました。_plugins他のプラグインが機能していることを確認しましたが、これは機能していません。また、自分で入力したものを含め、エラーメッセージも表示されません。これは使用されていないようです。しかし、Jekyll は私の.Rmdファイルの HTML ファイルを生成していますが、単に R チャックをコード チャックとして処理しています。どんな助けや考えも大歓迎です。

RMarkdownConverter.rbファイル：

私の最初の R Markdown 投稿の内容:

私は、knitr によって HTML に処理される Rmd ファイルを作成しています。これには、図を生成するいくつかの R チャンクが含まれており、HTML にデータ URI として保存されます。

1) このような画像にキャプションを追加するにはどうすればよいですか? 「3」が自動的に生成される「図 3: 何とか何とか」のようなキャプションが欲しいです。

2) 後でこの画像を参照するにはどうすればよいですか。つまり、「図 3 でわかるように、何とか」。

xtableとRMarkdownおよびknitrを使用して、\input{}で呼び出す.texファイルを生成しています。うまく機能しますが、ここに示すような複数列を作成する方法がわかりません。誰かがこれを行う方法を知っていますか？

これまで私が使用しているもの：

「Mean」と「StdDev」（「Treatment」と「Control」）ごとに異なるグループ化ヘッダーが必要です。

あるいは、R Markdown / knitrを使用してテーブルを自動的に生成するためのより良い方法はありますか？レポートは自動的に生成される必要があるため、テーブルを手動で編集したくありません。

更新： @agstudy：私はlatexを初めて使用しますが、これはxtable（またはxtableのようなもの）を使用して自動的に生成しようとしている出力だと思います。

更新2： @Jonathan：あなたが提案していることを理解するのに数回読んだ。私はあなたの推薦を受けました、そしてそれはうまくいきました。

Rマークダウンチャンクで私は今使用しています：

次に、テキストでは、次を使用します。

ネイティブxtable（または他のパッケージ）ソリューションについて他に提案があるかどうかを確認します。そうでなければ、私はあなたの答えを受け入れます。ありがとう！

RStudio、R Markdown、Latex、および Pandoc を使用して、データのクリーニング、変数の構築、分析の実行、および結果の報告を行っています。私は再現可能な研究の概念に慣れていませんが、夢中になっています。とても理にかなっています。

動的な表と図は問題ありません。しかし、動的テキストには困惑しています。インライン コードを挿入して、すべての統計の 95% が誤りであることを示すことができますが、再現可能な方法で言語を変更する方法がわかりません。

たとえば、オブジェクト x=0.66 があり、「歯科医の 3 人に 2 人が Crest を使用しています」と書きたい場合はどうすればよいでしょうか? x の現在の値 0.66 を見て、テキストに「2 out of 3」と入力できますが、これは再現できません。新しいデータを取得して分析を再実行すると、x が 0.52 になったとします。私のテキストは古くなっているでしょう。確かに、歯科医の 52% が Crest を好んでいると動的にレポートすることはできますが、すべてがパーセンテージでレポートされると、レポートが古くなります。

私の考えでは、文章を変更したいときにテキストで呼び出すことができる関数を作成できたということです。たとえば、「out.of」関数は if else ステートメントで機能してテキストを生成できます。

また、10 分の 1、5 分の 2、3 分の 1 などの分数関数を作成することもできます。

他の人がすでにこの問題に取り組んでいると確信しています。手がかりはありますか？アイデア？

RstudioでRmarkdownを使用して、次のプロットをhtmlドキュメントとして生成しようとしています:

しかし、次のエラーが表示されます。

ただし、プロットは Rstudio の「プロット」表示で完全に生成されます。Rmarkdownが関数を見つけて出力を表示できるようにするためにできることはありますか? ありがとうございました

作業ディレクトリに保存された Rdata の一部を使用して表示する Rmd ファイルがあります。cache=FALSE もあります。KintHTML ボタンをクリックすると、html ページが表示されます。Rstudio コンソールに行き、knit('TestReport.Rmd') と入力すると、エラーが発生します。

evaluate(code、envir = env、new_device = FALSE、stop_on_error = opts_knit$get("stop_on_error")) のエラー: 未使用の引数 (new_device = FALSE、stop_on_error = opts_knit$get("stop_on_error"))

何が間違っている可能性がありますか？評価パッケージもインストールしました。

重複の可能性:
Sweave、ソースの R-Function ファイルを含める

私は報告書を作成するためにknitrを使用しています。すべての分析コードを関数として別の R ファイルに書きました。次に、これらの関数を使用して、R Markdown ファイルに分析コマンドを記述しました。最終的に生成された HTML ファイルは見栄えがします。元の R ファイルのすべての関数を一覧表示できる R Markdown ドキュメントの最後のセクションを追加したかったのです。私は次のことをしました：

これの出力は、生成された HTML ファイルで次のようになります。

これはきれいに見えません。適切にフォーマットされた Knitr の R ファイルのリストを取得したいと考えています。いつでもコピーして貼り付けることができますが、より洗練されたソリューションを探しています。ありがとう！

Rstudio を使用して Rmarkdown 言語でレポートを作成してから、mdファイル (ファイルではなくRmd)docを pandoc を使用して形式に変換します。doc各図には、出力ファイルにキャプションがあります: "plot of chunk unnamed-chunk-xxx" . もちろん、このキャプションはmdファイル内で変更できますが、ファイル内で直接変更できるかどうかは疑問Rmdです。