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python - Scanpy Violin プロットを並べてプロットする際の問題
scanpy を使用していくつかのデータの分析に取り組んでおり、3 つのバイオリン プロットを並べてプロットしようとしていますが、うまく動作しないようです。サブプロットをいくつかの異なる方法で使用してみましたが、バイオリン プロットが間にある空のチャートが表示され続けます。いくつかの異なる戦略を試しましたが、1x3 グリッドでそれらを並べることができないようです。以下は、ヴァイオリン プロットの上に空のプロットが積み重なったプロットの一部と共に、私の最新の試みです。
サンプル
python - Linux 環境に ScanPy と AnnData をインストールしましたが、次の ImportError が表示されます: can't import name 'PathLike' from 'anndata.compat'
Linux 環境に ScanPy と AnnData をインストールしましたが、次の ImportError が表示されます: can't import name 'PathLike' from 'anndata.compat'
次のパッケージをインストールしました: conda install seaborn scikit-learn statsmodels numba pytables conda install -c conda-forge python-igraph leidenalg pip install scanpy conda install -c bioconda anndata
これらはバージョンです: pytables 3.6.1 igraph 0.9.2 scanpy 1.7.2 anndata 0.7.6 Python 3.7.10
するとimport anndata、次のエラーが表示されます。