問題タブ [scatter]

サイズが 27000 行 x 22 列の大きな csv ファイルを計算するスクリプトを作成しました。このスレッドのような散在するプロットで matplotlib で使用するために CSV ファイルを読み込むにはどうすればよいですか?

散布図の軸範囲

散布図を生成する概念は理解されています。csv ファイルを解析する試みが次のように行われました。

しかし、成功しませんでした。

いわゆるBeeswarm箱ひげ図を作成する関数を探しています。これは医学や生物学で使用される非常に人気のあるプロットであり、MATLABで見つからなかったことに驚きました。

基本的に、各グループの数値データはビンに分割され、ポイントのジッターは特定のビン内のポイントの数に依存します。

BEESWARM関数を使用してRで実行された例を次に示します。

追加のグループの色を変えることは非常に素晴らしい機能ですが、今は必要ありません。

markerConfig 構成でカスタム散布タイプを作成するにはどうすればよいですか?

たとえば、これはCircle scatter です。

三角散乱が必要です。したがって、以下のコードを使用すると:

このエラーが発生しました：

またはパス: [100,100,300,100,200,300]

SVG Triangleのサンプルはこちら: http://www.w3.org/TR/SVG/paths.html#PathData

前もって感謝します

ここに染色体の長さ全体の値をプロットします

ポイントのない中央の領域にはデータが含まれていないため、レスラインを取得することはできません。この領域のレスラインを停止するようにコードを変更するにはどうすればよいですか？データは連続していますが、空白の領域を特別な値でマークする行を追加したり、ラベルの付いた列を追加したりできますか？しかし、これをコマンドで使用するにはどうすればよいですか？

私の現在のコマンド：

（これは、私が良い答えを得たggplot2 loess Qに続きます）-このプロットにつながります：

私のRの知識はかなり限られています（ごめんなさい！）

テーブルdata1のデータを使用して散布図をプロットします。

一部の領域にはデータがありません（中央に1つの大きな領域がありますが、小さな個別の領域も含まれます）。この事実を説明するために、y=0で色付きのセグメントを描画します。

両方のデータ型をラベルcolumn＃10 ='type'（散布データ='cnv'およびno-data='nregion'のコンテンツ）を持つ1つのテーブルに結合しました。nregionsの値の列は0です。

分散用に「cnv」データのみを取得し、セグメントを描画するために「nregion」データのみを取得するにはどうすればよいですか。同じプロットの両方？

geom_segmentを見つけました：

しかし、各ggplotサブプロットをサブセット化する方法が見つかりませんでした。

ありがとう

こんにちは@gauden私はあなたのアプローチを試しました、そしてそれは部分的にうまくいきました。私の問題は、]-1を使用する場合ほどデータをうまく分割できないことです。0]私のnregionは散在しており（画像の青い点と線で表されています）、次の画像のように、新しいグラフごとに異なります。

その結果、レスは以前のように大きなnregionを通過します。nregionsでレスを防ぐにはどうすればよいですか？

OLD: 3 種類のエラーが表示されます。scatterv カウント エラー、segmentationfault 11 が発生するか、プロセスが動かなくなることがあります。どのエラーが発生するかはランダムのようです。毎回2つのprocでコードを実行します。スタックすると、printf("print2: %d" , myrank); の前でスタックします。私の友人が自分のコンピューターで 2 つのプロセスを使用してコードを実行すると、最初の MPI_Bcast を通過しません。実行しても何も出力されません。ここに私が得るエラーへのリンクがあります: http://justpaste.it/zs0

更新された問題: " printf("print2: %d" , myrank); " の後、scatterv 呼び出しの前にセグメンテーション違反のみが発生するようになりました。printf ステートメントの後のすべてのコードを削除しても、セグメンテーション違反が発生しますが、それはコードを 3 つ以上のプロシージャに対して実行した場合のみです。

私の仕事は、行列 A と B の並列行列乗算を行い、結果を行列 C に集めることです。

行列 A を行ごとに分割することでこれを行っており、各プロセスはその部分を使用して行列 B を乗算し、乗算からその部分を取得します。次に、プロセスからすべてのピースを集めて、マトリックス C にまとめます。

私はすでに同様の質問を投稿しましたが、このコードは改善され、進歩しましたが、scatterv 呼び出しの後にまだセグメンテーション違反が発生しています。

時間内のイベントのデータがあります。現時点では、x 軸が時間である散布図の y = 1 で、(黒い) マーカーで表されます。残念ながら、x には約 2 時間の不確実性があります。だから私は黒いマーカーを灰色のソーセージの形のように変えたいと思っています - その2時間の各時点でイベントが発生する可能性が等しく、すべてのイベントがプロットされたときに私がさまざまな時点で密度が高まっているのがわかります。

時間の経過とともに正確なマーカーをぼかして、均一な確率のソーセージを差別化する方法はありますか?

どうもありがとうございました。これが質問として明確に述べられていない場合はお知らせください。

2つの異なるy軸とカラーバーを持つ散布図を作成しようとしています。

使用される擬似コードは次のとおりです。

そして、それはこのプロットを生成します：

私の質問は、「波長」軸に異なるスケールをどのように使用するか、また、波長の邪魔にならないようにカラーバーをより右に移動する方法です。

ポイント位置にラベルを表示する散布図を Java で作成する必要があります。たとえば、位置 (10,20) に点があるプロットがあるとします。色付きの点ではなく、プロットのその位置に文字列を表示する必要があります。これはいくつかのライブラリを使用して可能ですか? 私はJChart2D、JFreeChartを試してみましたが成功しませんでした。通常の散布図しか得られません。

御時間ありがとうございます。