問題タブ [sweave]

Sweave の設定方法と Rpy2 の認識方法は?

私はこれを使います

しかし、私はこれらのエラーが発生します

あなたの答えと助けに感謝します

少し前にSweaveを使い始めました。しかし、ほとんどの人と同じように、私はすぐに大きな問題に遭遇しました。それは速度です。大きなドキュメントをスイーブすると、実行に時間がかかるため、効率的な作業が非常に困難になります。cacheSweaveを使用すると、データ処理を大幅に高速化できます。ただし、プロット（特にggplot;）-はレンダリングに時間がかかりすぎます。それが私がpgfSweaveを使いたい方法です。

何時間も経った後、私はついにEclipse / StatET/Texlipseで動作するシステムをセットアップすることに成功しました。次に、既存のレポートをpgfSweaveで使用するように変換したかったのですが、残念なことに、ほとんどのggplotが機能しなくなったようです。たとえば、次のプロットは、コンソールとSweaveで完全に機能します。

pgfSweaveで実行すると、次のエラーが発生します。

geom_pointからaes（...）を削除すると、プロットはpgfSweaveで完全に機能します。

編集：私は問題をさらに調査し、問題をtikz-deviceに減らすことができました。

これは問題なく機能します。

これにより、上記のエラーが発生します。

これも問題なく機能します。

5つの異なるggplotでこれを繰り返すことができます。マッピングで色（またはサイズ、アルファなど）を使用しない場合は、tikzで機能します。

Q1：この振る舞いについて誰か説明がありますか？

さらに、非プロットコードチャンクのキャッシュはあまりうまく機能しません。次のコードチャンクは、Sweaveではまったく時間がかかりません。pgfSweaveでは、約10秒かかります。

一部の変数のみが後で使用するために設定されているため、これもかなり奇妙な動作のようです。

Q2：その説明はありますか？

Q3：より一般的には、pgfSweaveをうまく使用している人がいるかどうかを尋ねたいと思います。成功すると、Sweaveで機能するすべてのものがpgfSweaveでも機能し、優れたフォントと速度の向上という追加の利点があります。;）

ご回答ありがとうございます！

1. ProjectSweave と R を使用して StatET と Eclipse を操作する場合、メニューの役割はありますか?

2. もしそうなら、これがどのように機能するかを説明する学習リソースはありますか?

3. これらのメニューは makefile 以外に何かを提供していますか?

適度に複雑な Sweave/LaTeX/R プロジェクトの構築についてもっと知りたいと思っています。具体的には、ProjectメニューにはオプションがClean...あり、Build Automatically興味をそそられます。

xtable の大きなテーブルを各ページにテーブル ヘッダーを配置するにはどうすればよいでしょうか? ページ間のテーブルを読みやすくします。

私は Sweave で以下を使用します。

回答ありがとうございます

xtableのテーブルに色の間隔を入れる方法は?

次の手順でテーブルを生成します。

答えてくれてありがとう

xtableinSweaveは素晴らしい動作をしますが、回帰ごとに1つのテーブルを実行します。rbindデータフレームをフィードすることもできるので、手動でpaste結果をデータフレームに入力してきましたが、それはあまりスケーラブルではないようです。

xtableのように機能するが、複数のlmオブジェクトで機能する、より自動化された堅牢なソリューションはありますか？論文/本に表示されるすべての表は手動で生成されていますか？フィードするデータフレームを生成する私のジャンキーコードに対するより良い解決策はありxtableますか？

データフレームを生成します：

Rの素晴らしいプロットパッケージを考えると、googleとrseekが私から何かを隠しているように感じます。

RファイルとRnwファイルを分離してload("file.R")から、最初のSweaveチャンクにRデータ/プロットをロードします。すべてのコードを実行せずに、ソースされたRファイルを付録に印刷する方法はありますか？source()（つまり、コードが十分に遅いので、echo=TRUEチャンクにまとめたくありません）。

ありがとう！

更新-実際、私のsource()アイデアはうまくいかないと思います。

私は何時間も立ち往生しています。Paul Johnsson (元のコードはこちらhttp://pj.freefaculty.org/R/outreg-worked.R )による R outreg 関数に、堅牢な標準エラー (およびその他のもの) を追加したいと考えています。

標準誤差を堅牢にする大きな問題があります。私が置き換えたコードで

と

とにかく、Sweave でラテックス ファイルを生成すると、堅牢でない標準エラーが表示されます。私は見ていて、コードチャンクは堅牢なSE（または元のコード以外の値）を返します。私は怒っています！=)

関数の完全なコードを次に示します。

Sweave での ggplot2 プロットのサイズの変更に関するこの質問を見つけました。を追加するSweaveopts{width=3, height=3}と、プロットのサイズは縮小されますが、テキストは縮小されません。したがって、最終的に、軸上のすべての数値が重なります。

元の ggplot2 呼び出しですべてのコンポーネントを手動でスケーリングする必要がないように、Sweave で ggplot2 プロット全体をスケーリングする方法はありますか? 私ができるはずのことのようですが、ggplot2の本やウェブサイトで見つけることができません。ありがとう！

FWIW、Sweave での呼び出しは次のとおりです。

そして、ggplot2 プロットを生成する呼び出し:

emacs-essからSweaveを実行すると、エラーはコードチャンク番号で提供されます。コードチャンク間を番号でナビゲートする簡単な方法はありますか？そうでなければ、それらを識別するのは困難です。