問題タブ [violin-plot]

seaborn ドキュメントのこのページの4 番目の例のように、ggplot を使用してスプリット バイオリン密度プロットを作成したいと思います。

ここにいくつかのデータがあります：

回避されたバイオリンを次のようにプロットできます。

しかし、横に並んだ分布のさまざまなポイントで幅を視覚的に比較することは困難です。ggplot でスプリット バイオリンの例を見つけることができませんでした - 可能ですか?

ベースの R グラフィックス ソリューションを見つけましたが、関数が非常に長く、分散モードを強調したいと思います。分散モードは、ggplot に追加レイヤーとして簡単に追加できますが、その関数を編集する方法を理解する必要がある場合は難しくなります。

次のデータセットがあるとしましょう1

同じグラフで各水ロガー値の箱ひげ図を作成したいと考えています。私がチェックしたところはどこでも、人々が使用する因子変数を持っていることを確認しました。ただし、要素は必要ありません。列名としてウォーターロガー番号を使用しています。一般的な boxplot コマンドでこれを行うことがboxplot(data$colname1, data$colname2, data$colname3, and so on)できますggplot2。

グループ化されたバイオリン プロット (図を参照) を作成しようとしています。ここでは、4 つのカテゴリ変数に対して 3 つのレベルをプロットしています。プロットは、ボックスが背後の幅の広いバイオリン プロットと同じ色で表示が難しくなっているという事実以外のデータを考慮すると、問題なく表示されます。理想的には、すべてのボックスを全体的に白のままにしたいと考えています。ボックスの色が変わっている理由は、fill選択した に対応していることを理解しています。geom_violinの塗りつぶしをから分離する方法があるかどうか疑問に思っていgeom_boxplotます。

これが私が使用しているコードを取り除いたものです

私が作成しているプロットの例

私は、3 つの異なる病状とそれらのいくつかの結果を含むデータを持っています。疾患は最初の列にあり、転帰は 2 番目の列から名前が付けられます。添付のデータをご覧ください。

次に、以下を使用して、添付の図を作成しました ( Figure1 )。

ただし、このような図を生成したいと思います ( Figure2 )。基本的には、図を横向きにして、すべてのデータを 1 つのパネルにまとめたいと思います。

これを理解するのを手伝ってくれたら嬉しいです? 事前にどうもありがとうございました。

1 つの種 (パン) のバイオリン プロットを使用している場合、コードは次のようになります。

女性を赤、男性を青で単一のプロットを生成します。ただし、この変数に含まれるすべての種を反復処理したいと思います。

vioplot は任意の数のデータセットを受け入れるので、種ごとにメスとオスの両方が必要なので、2*(種の数) のデータセットを生成して vioplot に渡す必要があります。したがって、2 つの種の場合は次のようになります。

「by」と「apply」でこれを試みましたが、これまでのところ成功していません。

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私のデータの例: