0

lmfitPythonとモジュールを使用してマルチパラメータフィットを実行しようとしています。私は、コードの基礎として、ここに示されている例に従っています。コードを理解している限り、目的関数を適切に定義し(残差を与える)、適切な引数を指定すれば、最小二乗近似を実行できるはずです。

これが私の現在の目的関数です。

# Define objective function: each data point has a different
# objective function which is defined by the model method
# the objective function returns the array to be minimized
def objfunc(params,trans,sum_in,sum_out,data):
    """ model fit using branching ratios and resonance strength
        then subtract data """
    model = fit_model(params,trans,sum_in,sum_out)

    return model - data

ここで、fit_model(args*)メソッドは次のように定義されます。

def fit_model(params,trans,sum_in,sum_out):
    """ model the transition based upon the input string trans
        using parameter convention for the branching """
    model = []

    # The amplitude: technically the resonance strength term
    # here it gives the number of resonant decays
    amp = params['amp'].value

    # For each transition we want to retrieve the parameter values
    # for the branching ratios and evaluate the new value for
    # the fit (of that transition). The easiest way to do this is
    # to store the braching ratios with the same notation used
    # previously, and to explicity call those values using the
    # 'params.['']value' method
    for i in range(len(trans)):

        # Employs the termvalue() method to evalueate the branching
        # and efficiency values
        model.append( str(amp * termValue(trans[i]) + amp * termValue(sum_in[i]) - amp * termValue(sum_out[i])))

    return np.array(model,dtype='float64')

これにより、私が期待するもの、numpy.ndarrayつまりデータの長さがわかります。私が抱えている問題は、カイ二乗適合を最小化しようとすると、

result = minimize(objfunc,params,args=(trans,sum_in,sum_out,data)) 

エラーメッセージが表示されます:

File "path/chisquare.py", line 94, in <module>
    result = minimize(objfunc,params,args=(trans,sum_in,sum_out,data))
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/lmfit-0.7-py2.7.egg/lmfit/minimizer.py", line 498, in minimize
    fitter.leastsq()
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/lmfit-0.7-py2.7.egg/lmfit/minimizer.py", line 369, in leastsq
    lsout = scipy_leastsq(self.__residual, self.vars, **lskws)
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/optimize/minpack.py", line 278, in leastsq
    raise TypeError('Improper input: N=%s must not exceed M=%s' % (n,m))
TypeError: Improper input: N=26 must not exceed M=25

私はこれが何を意味するのかをlmfitソースコードから理解しようとしましたが、それは私の理解を少し超えています。このエラーを解決する方法を知っている人はいますか?

ありがとう

4

1 に答える 1

1

この問題は、データ ポイントよりも多くのパラメーターがあることが原因のようです。入力内容を確認し、問題を解決しました!

于 2013-01-16T16:21:36.500 に答える