問題タブ [density-plot]

これと同様に、matplotlib を使用して xy データの複数の hexbin 密度マップを作成したいと思います: http://matplotlib.org/1.4.0/examples/pylab_examples/hexbin_demo.html

しかし、すべての密度プロットが同じ色になり、すべてのプロットでカラーバーが [0,1] の範囲になるように、六角形ごとのカウントを特定の数値 (密度マップからの最高ピーク値) で割りたいと思います。 .

誰かがその実例を見せてもらえますか?

期待していただき、ありがとうございます。

ジャノス

範囲が異なる 2 つの列を含むデータの密度プロットを実行しようとしています。RMSD 列は [0-2] で、角度は [0-200] の範囲です。

ファイル内の私のデータは次のようなものです：

1. x軸とy軸の両方を範囲の1/10にビニングしたい
2. 同じで開始する両方の軸の 0

3. このように行列の各グリッドの要素数を出力し、これらの要素数に基づいて密度プロットを作成します

   /li>

1-D ビニングを行う方法を見つけることはできますが、それらの値から密度プロットを作成する方法に困惑し、あえて 2-D ビニング + プロットを試みることさえできませんでした。

助けてくれてありがとう

smoothScatter()関数を使用して、2 つの異なるデータセットの 2 次元密度をプロットしたいと思います。

しかし、プロットを使用して 2 つのデータセットを比較するには、カラー コードを同一にする必要があります。つまり、密度関数の特定の値 Xi が両方のプロットで同じ色に対応するようにします。

これは可能ですか？

私はいくつかのデータをビニングし、現在、2 つの列で構成されるデータフレームを持っています。1 つはビンの範囲を指定し、もう 1 つは次のように頻度を指定します。

これを使用してヒストグラムと密度プロットをプロットしたいのですが、新しいビンなどを生成せずにそうする方法を見つけることができないようです。ここでこのソリューションを使用して、次のことを試みました:-

しかし、それはクラッシュします。これに対処する方法を知っている人はいますか？

ありがとうございました

これが相互検証されるかどうかはわかりませんが、わかります。基本的に、最近、機器からデータを取得しました (0 から 630 までの化合物の質量)。以下に示すように、ヒストグラムをプロットする前に、0.025 ビンにビン化しました。

周波数が高く、バックグラウンド ノイズに対して際立っているビンを特定したいと考えています (軸上で右から左に移動すると、バックグラウンド ノイズが増加します)。ほとんどぼやけて黒い塊になったポイントの上に曲線を描き、その曲線の上にあるビンを選択してさらに調査することを想像してみてください。それが私がやろうとしていることです。カーネル密度プロットをプロットして、それをヒストグラムの上に重ねて、それを使用してプロットの上に存在するポイントを特定できるかどうかを確認しました。ただし、密度が低すぎる値であるため、密度プロットはこれでまったく前進しません (2 番目のプロットを参照)。この問題を解決するにはどうすればよいかについて、誰かに推奨事項はありますか? 青い線はオーバーレイされた密度関数プロットを表し、赤い線は理想的なソリューションを表します (これを R で自動化する方法が必要です)

以下のデータは私のデータセットの一部にすぎないため、実際には私のプロット (約 300,000 ポイントを含む) を適切に表したものではありません。また、ビンのサイズが非常に小さい (0.025) ため、データが膨大に広がっています (合計で 25,000 あります)。またはそうビン）。

eps ファイルに保存したい密度プロットがあります。

私の密度プロットは次のようなものです

私のデータだけで、もう少し複雑です（ラベルとマージンの変更、その上の行の追加など）。

私の問題は、y = 0 の密度プロットの上に迷惑な水平の細い灰色の線が表示されることです。これを取り除きたいと思います。

X デバイスに直接プロットすると、この水平の灰色の線は表示されませんが、postscript では常に表示されます。

の代わりにdev.copy2epsand も使用してみましたが、それでも灰色の線が表示されます。cairo_ps()postscript()

また、上記のコード ブロックのような非常に単純なプロットを使用して、別の (ランダムな) データを使用してみましたが、それでも Postscript に灰色の線が表示されます。

この行を削除する方法を知っている人はいますか?