問題タブ [jupyter-irkernel]

jupyter ノートブック シェルから r ファイルを開こうとすると、カーネルが起動できず、次のように表示されます。

ターミナルが表示されている間：

MAC OS で anaconda3 を使用し、conda -install -cr r-essentials を使用して r パッケージをインストールします。ipython の再インストールを何度か試みても、まだ機能しません! ご清聴ありがとうございました。

Python 2.7、R 3.2.5、RStudio、Eclipse with PyDev、Jupyter Notebook 4.0.4 をインストールしました。Windows 10 x64 を使用しています。

http://irkernel.github.io/installation/に従ってすべてを実行しましたが、エラーはありませんでした。Jupyter Notebook を起動すると、ドロップダウン リストに R カーネルがありません。jupyter-kernelspec list と入力すると、次のように表示されます。

利用可能なカーネル:

python2 c:\python27_64\lib\site-packages\ipykernel\resources ir C:\Users\User\AppData\Roaming\jupyter\kernels\ir

私は何をすべきか？

I've been using Jupyter for some data analysis in R with irkernel but it seems that there is not an obvious workflow to generate tables that could then be used for publication. Mathjax doesn't support latex tables and markdown tables are pretty basic. Ideally there'd even be a way to programmatically generate the tables from variables in R. For an example, here is a table that I would consider complex and ready for publication.

O'Reilly ビデオ チュートリアル ( http://shop.oreilly.com/product/0636920044260.do )の指示に従って、MacOS 10.10.5 で Jupyter ノートブックの新規インストールを実行しています。miniconda をインストールした後、R カーネル用の環境を作成します。

その環境内で、jupyter ノートブックを開始して、新しい R ノートブックを作成できます。

ただし、実行しようとすると：

Dead kernel エラーが発生し、ターミナルでカーネルが再起動します。

私は正常に実行できます：

クラッシュの原因と思われるのはライブラリ（dplyr）だけです。また、これが anaconda と miniconda の両方のインストールで発生することも確認しました。

クラッシュからの出力は次のとおりです。

これを引き起こしている原因について何か提案はありますか? jupyter カーネルが自然にクラッシュすることへの言及をいくつか見つけましたが、特に dplyr に関連付けられていると思われるものは何もありません。

ありがとう、

アレックス

Docker を使用して Jupyter をセットアップしようとしています。複数の言語のカーネル (python、scala、R など) を提供したいと考えています。今では R 以外でも動作するようです。「プロット」関数を実行するたびに、ブラウザーは「カーネルが死んでいるように見えます。自動的に再起動します」

ログのエラーメッセージは次のとおりです。

最初にブラウザ（Google Chrome）の機能を実行すると、機能png()が正常に実行されます。なぜこれが起こるのか、またはを実行した後に何が変わるのかわかりません。Jupyter または R で同様の問題に遭遇した人はいますか?jpeg()plot()png()jpeg()

R-Jupyterノートブックにこの最小限のコードがあります:

次の出力が得られます。

セルを実行するだけの場合:

私はこの出力を取得します（その順序で）：

興味深いことに、以下はエラーをスローしません。

なぜこのエラーが発生するのですか?

そして、なぜそれは垂直に印刷されますか?

Out[]を使用しているときにラベルを取得できないのはなぜprint()ですか?

関数なしで呼び出されたときにJupyterがオブジェクトの値を出力する方法に関係があるようprint()です...そして、計算自体は正しいことに注意してください。エラーは有害ではないようです。 ：P

注:このエラーは bash でも rStudio でも発生せず、Jupyter でのみ発生します。

X11 を使用せずに Linux クラスター コンピューティング ノードで jupyter IPython ノートブックを実行することがよくありますが、問題はありません。ただし、同じセットアップで R カーネルを実行すると、うまく機能しません。

マシンの詳細は次のとおりです。

• CentOS 7.2
• X11、png、cairo 機能を備えた R 3.3.1
• アナコンダ 4.0.0 (python 2.7.11)

ノートブックを起動するだけで、最初のセルがログに記録された状態で実行された後にカーネルがクラッシュします。

でノートブックを起動することで動作させることができますxvfb-run jupyter notebook。これにより、セルで R コマンドを実行できますが、プロットを作成しようとすると、次のようになります。

x11 フォントをインストールできれば動作すると思いますが、これはクラスターの計算ノード上にあり、それらをインストールするための管理者権限がありません。

X11なしでLinuxマシンでグラフィックスを生成するためにRカーネルでjupyterノートブックを構成する正しい方法は何ですか?

私はフォーラムにかなり慣れていないので、この質問が既に回答されている場合は申し訳ありません。周りを見回したところ、同様の問題がいくつか見られましたが、以前の投稿で問題の解決策を見つけることができませんでした. だから - ここに行きます...

Mac OS X 10.11.5、Jupyter Notebook バージョン 4.2.1、R バージョン 3.2.2 を実行しています

次のコマンドを使用して、Jupyter ノートブック用の R カーネルをインストールしました -

ここで、Jupyter ノートブックを起動すると、右側の [ノートブック] の下のドロップダウン メニューにオプションの 1 つとして [R] が表示されます。ただし、R ノートブックを作成しようとすると、カーネルがクラッシュし、ターミナルに次のエラーが表示されます。

ここからどこへ行くことができますか？

ありがとうございました！