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pipeline - Nextflow の条件付きパイプライン
条件付きパイプライン NextFlow を作成しようとしています。例えば、
プロセス A はチャネルに値を出力します。値が 1 の場合は X を実行し、それ以外の場合は Y を実行します。
これが私がやろうとしていることです:
foo と bar は同等であるが実装が異なると仮定します (たとえば、一方は映画を AVI から h.264 に変換し、もう一方は MOV から h.264 に変換します)。トリガーについて何も知らなくても Bar または Foo から読み取ることができる別のプロセス、たとえば C が必要です。しかし、Foo と Bar の両方で同じ出力チャネル名を使用すると、nextflow は文句を言います。
nextflow - 出力を受け取る場所を nextlow に示す方法は?
特定のディレクトリにファイルを保存するPythonのスクリプトがあります。
たとえば、「write.py」という名前のこのコード:
したがって、「project/src」でスクリプトを実行すると、このスクリプトの出力は「project/results/txt/」になります。
「project/」のスクリプト Nextflow の例を次に示します。
"../../../" ==> 作業ディレクトリの外に出る
しかし、nextflow は "projet/results/txt/output.txt" が見つからなかったと返します。
では、スクリプトの出力がどこにあるかを Nextflow にどのように示すのでしょうか?