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python - nipypeを使用してFLIRT登録を追加の画像エラーに適用する
私はnipypeパッケージを使用してPythonでいくつかの登録を行おうとしています。それは基本的な登録のために働きました：
これにより、登録が成功しました。ただし、出力されたflt.inputs.out_matrix_file ='subject_to_template.mat'を使用して、この登録変換を入力MRIと同じ空間の非脳画像に適用しようとしています。
私は次のことを試しました：
flt.inputs.in_matrix_fileおよびflt.inputs.apply_xfm=Trueフラグが標準の登録をオーバーライドし、マトリックスを使用して追加の画像を登録することを期待していますが、次のエラーが発生しました。
なぜ、どうすればこれを解決できるか知っていますか？
python - avscale (FSL スクリプト) 用の nipype インターフェイスはありますか?
FSL によって作成された変換行列を分析するために nipype を使用しようとしています。FSL には、これらの変換行列 (*.mat ファイル) を分析する「avscale」というスクリプトがあります。nipype に、そのスクリプトをラップしてその出力を操作できるインターフェイスがあるかどうか疑問に思っていました。
ありがとう
python - C で記述された Python モジュールをクローンされた Git リポジトリにインポートすると、ImportError が発生する
NiPy リポジトリのクローンを作成しましたが、インポートしようとするとnipy.algorithms.registration、次のエラーが発生します。
リポジトリに intvol.c と intvol.pyx という 2 つのファイルがあることがわかりました。どうしたの？
解決済み: 以下の最初のコメントを参照してください。
python - Pythonでimg/hdrファイルのリストをnifti1imageに変換
img/hdr ファイルのリストがあります。list の長さが 50 で、img のサイズが 60*60*60 であるとします。サイズが(60*60*60*50)のNifti1imageに変換したいと思います。
上記のプログラムで、Nifti1image に変換したいリストを取得します。
しかし、私は働きませんでした。誰かがPythonでこれを行う方法を教えてもらえますか?