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r - サンプリング サイトによる希薄化プロットをどのようにプロットしますか?
私の問題の簡略版:
A、B、Cの3つのサイトにまたがる60個のサンプルポイント(それぞれにさまざまなOTUの存在量を持つ)を持つOTUテーブルがあります。各サイトには20個のサンプルがあります。
A、B、C の各サイトの希薄化曲線をプロットしたいと思います。各サイトから「十分な」シーケンスがサンプリングされたかどうかを確認するために、サイトの曲線が安定しているかどうかを確認したいと思います。
現時点では、私はこれをやっています:
現在、すべてのサンプル ポイントが個々の曲線としてプロットされています。これは私が望んでいるものではありません。各サンプリング サイトの全体的な曲線をプロットしたいと考えています。