問題タブ [vcftools]
For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.
linux - ファイルで-1を絞る方法
次のようなファイルがあります
要素「-1」を
しかし、うまくいきません。
追加した
vcftools を使用して、vcf.gz を要素 "0"、"1"、または "2" (chr1.012 など) の行列に変更します (欠損値は "-1" になります)。しかし、各行の長さが異なることがわかりました。だから「-1」のせいなのか疑問です。だから私は「-1」要素を絞りたい。
bioinformatics - plinkを使用してvcfファイルをpedファイルに変換するには?
plink を使用して .vcf ファイルを .ped ファイルに変換しようとしています。オンラインでいくつかのマニュアルと投稿を読みましたが、vcf を ped に変換する方法について特に言及している人はないようです。
vcf を ped に変換するための plink の経験がある専門家がここにいることを願っています。知識を共有していただければ幸いです。さらに、それを行う別の方法 (非 plink) があれば、共有してください。
ありがとうございました！
c++ - 「bool」を「gzFile {aka gzFile_s*}」に変換できません
Linux 環境は初めてで、バイオインフォマティクス パッケージ (vcftools - https://vcftools.github.io/examples.html )をインストールしようとしています。何らかの理由で、Cygwin 環境で問題なくコンパイルできます。他の同僚は問題なくパッケージをインストールしましたが、同じコンピューターの VirtualBox で Ubuntu 環境でコンパイルしようとすると、エラーが発生します (以下のとおり)。次のエラーが表示されます。このエラーを解決する方法について誰か提案がありますか?
$make インストール