問題タブ [cox-regression]

NAのないdata.frameからフォワード手順でCoxモデルを選択したいです。サンプルデータは次のとおりです。

この表には何の意味もありませんが、とにかくモデルを構築しようとすると:

転送は最初のステップで終了し、次のように述べています。

in is.na(fit$coefficients) : is.na() はタイプ 'NULL' の非 (リストまたはベクトル) に適用されます

(3回)

上位モデルを変更しようとしましたが、試してみupper = ~ 1ましたが、警告が残ります。わかりません: NA がなく、ベクトルはすべて数値です (確認しました)。人々が同じ問題を抱えているかどうかを検索しましたが、見つけることができたのは、ベクターの名前またはクラスによる問題だけでした。

コードの何が問題になっていますか?

パッケージ coxme を使用しており、最適なものを選択するために、モデルから AIC を抽出したいと考えています。

1) これを直接行う方法がわかりませんでした。関数 coxme() のコードを変更しない限り、これは不可能だと思いますが、間違っていれば幸いです。

2）次のコマンドで関数のコードを調べました：

ストックAICに変数を追加してコードを見たが、たとえば「coxme2」と呼び（最初に​​coxme2 <-を追加するだけ）、それを使用しようとすると（他の追加なしで）、エラーが発生します:

colnames<-(のエラー*tmp*、値 = c("NULL"、"Integrated"、"Fitted": 'dimnames' [2] の長さは配列の範囲と等しくありません

要約すると、coxme 関数はうまく機能しますが、そのコードをコピーして貼り付けるだけでは機能しません。この問題を解決するにはどうすればよいですか?

私は使用Python 2.7してMac OSX Lionおり、使用するためにインストールrpy2しますCox Proportional Hazards Model

私はただ疑問に思ってrpy2いました.以前にコックス比例ハザードを行った人はいますか. rpy2私はパッケージに関するいくつかのドキュメントを読んでいましたが、dataframesさまざまな機能を実行する方法を述べるのではなく、主に作成などについて話しています。では、この関数を呼び出して、依存関係と変数 (バイナリ値で指定) を指定するにはどうすればよいでしょtime variableうcensoringか1?

Mac 用の R パッケージでは、使用中はコンピューターをインターネットに接続しないことも推奨されています。何故ですか？

私はサバイバルパッケージを使用してRで成層コックス回帰を行っています:

これは問題なく動作しますが、sampling パッケージを使用すると、survival パッケージのストラタ関数が非表示になり、直接使用できなくなります。

ただし、明示的な名前空間で呼び出してsurvival::strataも層別分析は作成されません。

そう、

これはなぜですか、また、この機能が非表示になっているときにこの機能にアクセスするにはどうすればよいですかsampling::strata(サンプリング パッケージをデタッチする以外に ;-)

Rバージョン2.15.2を使用しています

ありがとう、デルタカッパ

アップデート：

私が行ったサンプリングパッケージと一緒にsurvival::strataを使用するための回避策として

これにより、基本パッケージのすぐ上に検索優先度の低いサンプリング パッケージが読み込まれます。それから私はすることができます

sampling::strata明示的に呼び出している間。

coxphを使用して作成されたcox比例ハザードモデルで機能する、lmtestパッケージのlrtestのような尤度比検定を知っている人はいますか? lrtest は coxph モデルでは機能しないようです。

ありがとう