問題タブ [ggtree]

背のパターンごとに異なる色の先端点を示す系統樹を作成しようとしています.数週間前に最初にこれを試みたときは完全に機能しましたが、今試してみると上記のエラーコードが表示されます. 前回から変更した唯一のことは、いくつかのパッケージを更新することです。

私が使用しているコードは次のとおりです。

このエラーに関する他のクエリに基づいて、データにNAがありません。使用するまでツリーは正常にロードされますgeom_tippoint(aes(fill = PATTERN))

このコードは以前に機能しており、データの構造 (文字と数値) を変更していないため、問題がどこにあるのかわかりません。

データ スニペット:

前もって感謝します。

編集:「frogdata」からの私のデータスニペットを dput を使用すると、次のようになります。

「frogtree.2」のスニペットは次のとおりです。

このツリーは newick ファイルとしてインポートされました。

私が使用しようとしたパッケージは次のとおりです。

更新: @Skaqqs が提供したコードを使用しています。

これは ggtree コードで動作します:

しかし、dat.1 DF は私のデータ セットと一致しないため、生成されるツリーは有効ではありません。また、データ セット (DF 全体の完全な dput 出力) を使用して、REGION を形状美学としてツリーに追加できるかどうかも確認したかったのです。

次に、データ セットから別の DF を作成しました。

それをプロットしました：

しかし、次の警告メッセージが表示されます: 警告メッセージ:

そして、この図：

https://i.stack.imgur.com/JxdCq.png

この警告コードと欠落しているヒント ポイントを取得するためのデータ セットの何が問題なのかわかりません。私が確認できる NA はありません。

Newickファイルで系統樹を作りたい、内容はこんな感じ

しかし、そのファイルで系統樹を作ろうとしたら、こんな感じで出力されました。

x軸を壊さなければならないと思うのですが、わかりません。

私が望む出力はこのようなものです。