問題タブ [gplots]

次の行を覆わないように、2 行を折り返して覆うテキストをプロットするにはどうすればよいですか? 次に例を示します。

textタイトルの単語がナンバーワン (1) を覆っていることは容易にわかります。

そのため、同様のテーマの投稿を多数見てきましたが、どれも私が必要としているものではないようです。または、提供されたソリューションを本当に理解していないだけです...

チンパンジーのデータを調べるために、lme4 で混合効果モデルを実行しました。私には、扶養者 (摂食時間) に影響を与える 2 つの要因 (攻撃率、交尾率) があります。

各予測変数と結果変数の間の関係を示す 2 つの散布図を作成したいと思いますが、モデル推定値から導出された線を引きたいと思います ((lm(y ~ x の abline ではありません) )) 完全な LMM に基づくものではなく、単純な回帰直線のみを与えるタイプ)。

これはggplot2でのみ可能であると感じていますが、実際にこれを行う方法を理解できていません。1 日のほとんどを本やフォーラムを調べて過ごしてきたので、彼らが何をしているのかを知っていれば、これがかなり簡単な答えになることを期待していました。

事前にヒントをありがとう！

アレックス

OSX (v. 10.9.2) で R (v. 3.0.3) を実行しています。

次のコマンドを使用して R スタジオに「gplots」パッケージをインストールしようとすると、エラーが発生します。

私は他の人が同じ問題を抱えているのを見てきましたが、提案されているように最新のRバージョンに更新しても問題は解決しませんでした

私が間違っていることについて何か提案はありますか?

「gplots」パッケージの heatmap.2 関数を使用しており、ビジュアル出力を微調整したいと考えています。

対称的な配色を取得したいのですが、scale="row" オプションを使用してそれを達成しました。ただし、これを行うと、範囲が小さな間隔 c(-1 , 1) に狭められます。データの範囲は c(-1.2 , 2.97) で、カラー スキームでデータのフル解像度を取得したいと考えています。色の範囲を c(-3,3) などに指定できますか、それともデータの解像度を高くする別の方法はありますか

これは私のコードです

このプロットの生成

修正したいもう 1 つの点は、カラー キーのタイトルを削除し、カラー キーの軸ラベルを手動で指定できるようにすることです。ありがとう

こんにちは、Rgplotsを使用してプロジェクトのヒートマップを作成しています。これまでのところ、このコードを書き、ヒートマップを正常に作成しました。

しかし今、別の配色を持つ既存のヒートマップにデータの別の列を追加したいと考えています。コメントしてください。

データのヒートマップを準備しようとしていますが、このエラーが表示される理由がわかりません。

私のデータ:

ヒートマップの作成に使用するコード (他のデータでも機能します):

問題を回避するために Na/NaN/Inf を 0 に置き換えようとさえしました:

しかし、エラーはまだ表示されます:

チュートリアルに従って光沢のあるサーバーをインストールしました: here。次のメッセージに示すように、サーバーは自動的に開始されました。

次に、/etc/shiny-server にフォルダーを作成し、その中に次の構成でファイル Shiny-server.conf を作成しました。

/var/www の下に、shiny-server というフォルダーを作成し、/var/www/shiny-server (つまり、/var/www/shiny-server/dummy) 内の dummy というフォルダーの下に Web アプリを配置しました。最後に、もう一度shiny-serverを起動しました（sudo start Shiny-server）。サーバーが実行されているというメッセージが表示されました。ただし、Web ブラウザーを開いて入力すると、次のようになります。

私は何も得ませんでした。

R内から光沢のあるアプリを起動できるので、光沢が正しくインストールされていると思います。誰でも私の問題を解決するのを手伝ってもらえますか?

私は使用してperl-cgiから呼び出しています

my $call = qx(Rscript tcga_analysis.R $bg_name $ctr_name $set $user);

サーバーでunixから使用するRscript myRscript.Rと動作しますが、perlからはパッケージをロードできないようです。次のエラーが表示されます (Apache ログから):

Error in library(gplots) : there is no package called 'gplots'

.libPaths() を使用:

ホームフォルダーに私の個人的なライブラリが表示されます。

使ってみた

しかしlib.loc error、そこにはライブラリ ツリーがないということわざがあります。.Rprofileライブラリへのパスを含む作業ディレクトリにファイルを作成しましたが、成功しませんでした。私も追加しようとしましpos=1たが、成功しませんでした...

ただし、Rを開いて呼び出すlibrary(gplots)と機能します

これは、Web インターフェイスを使用する分析パイプラインの一部であるため、perl から Rscript を呼び出して動作させる必要があります -> perl-cgi -> R を使用して一部のデータを分析します!

ありがとう ：）