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For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.
python - DNA 配列からアラインメント スコアを取得するにはどうすればよいですか?
私はBiopythonのpairwise2関数にある程度精通していますが、可能な限り最高のアライメントスコアを得るために、シーケンス内にダッシュを追加することに気付きました. 例えば、
次の結果が得られます。
2 番目のシーケンスの最初の 2 文字 (A & C) は 1 番目のシーケンスと一致しますが。アラインされた塩基対の最大数ではなく、アラインされた塩基対の数を見つける方法はありますか (たとえば、ACTGAA のシーケンスは、GCCGTA のシーケンスに対して 3 のスコアを持ちます)
r - データのサブセットのペアワイズ ANOVA
R で複数のペアワイズ ANOVA を実行し、bonferroni を使用して p 値を修正する必要があります。ただし、すべてのクラスを互いに比較する必要はありません。以下は私のデータ形式とselcontrasts: log10relquant を対比する必要があるペアです。これを実行する方法を知っている人はいますか？dplyr、lsmeansおよびbroomパッケージを使用します。
現在、選択したコントラストの代わりに、これを使用してデータセット全体をペアにしています(すべてのクラスを比較するため):
リストxで選択したコントラストのみを実行するために、次のことを試しました：
しかし、私はエラーが発生します: